Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11428
• Subject: NM_001242793.1
• Aligned Length: 877
• Identities: 594
• Gaps: 282

Alignment

Query   1  MSGRTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSGQTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74

Query  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148

Query 149  KKGADGVMRTMAPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  KKGADGVMRTMAPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222

Query 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAE--------------APSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNKSGA  282
           |||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNKSGA  296

Query 283  PSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDLFATASAAVPVSTSKPSSDLLDLQPDFSSGGAAAAAAPAPPPP  356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  PSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDLFATASAAVPVSTSKPSSDLLDLQPDFSSGGAAAAAAPAPPPP  370

Query 357  AGGATAWG------------------------------------------------------------------  364
           ||||||||                                                                  
Sbjct 371  AGGATAWGDLLGEDSLAALSSVPSEAQISDPFAPEPTPPTTTAEIATASASASTTTTVTAVTAEVDLFGDAFAA  444

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 445  SPGEAPAASEGAAAPATPTPVAAALDACSGNDPFAPSEGSAEAAPELDLFAMKPPETSVPVVTPTASTAPPVPA  518

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 519  TAPSPAPAVAAAAAATTAATAAATTTTTTSAATATTAPPALDIFGDLFESTPEVAAAPKPDAAPSIDLFSTDAF  592

Query 365  -------------------------------------------------GFGGSFMAPSPSPVTPAQNNLLQPN  389
                                                            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  SSPPQGASPVPESSLTADLLSDAFGSSASEPQPASQAASSSSASADLLAGFGGSFMAPSPSPVTPAQNNLLQPN  666

Query 390  FEAAFGTTPSTSSSSSFDPSVFDGLGDLLMPTMAPAGQPAPVSMVPPSPAMAASKALGSDLDSSLASLVGNLGI  463
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  FEAAFGTTPSTSSSSSFDPSVFDGLGDLLMPTMAPAGQPAPVSMVPPSPAMAASKALGSDLDSSLASLVGNLGI  740

Query 464  SGTTTKKGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVAPATWSAGVPPSAPLQGAVPPTSSVPPVAGAPSVGQPGAGFGMPP  537
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  SGTTTKKGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVAPATWSAGVPPSAPLQGAVPPTSSVPPVAGAPSVGQPGAGFGMPP  814

Query 538  AGTGMPMMPQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPASQSPKKPPAKDPLADLN-----  595
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 815  AGTGMPMMPQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPASQSPKKPPAKDPLADLNIKDFL  877