Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11428
• Subject: NM_001277983.1
• Aligned Length: 872
• Identities: 539
• Gaps: 311

Alignment

Query   1  MSGRTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSGQTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74

Query  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148

Query 149  KKGADGVMRTMAPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  KKGADGVMRTMVPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222

Query 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAE--------------APSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNKSGA  282
           |||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNKSGA  296

Query 283  PSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDLFATASAAVPVSTSKPSSDLLDLQPDFSSGGAAAAAAPAPPPP  356
           |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||||||||| ||.||.||||. .||
Sbjct 297  PSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDIFATASAAAPVSSAKPSSDLLDLQPDF-SGAAAGAAAPV-VPP  368

Query 357  AGGATAW-------------------------------------------------------------------  363
           .||||||                                                                   
Sbjct 369  SGGATAWGDSLAALSSVPCEAPISDPFAPEPSPPTTTTEPASASASTTTAVTAVTTEVDLFGDAFAASPGEAPA  442

Query 364  --------------------------------------------------------------------------  363
                                                                                     
Sbjct 443  ASEGATAPATPAPVAAALDACSGNDPFAPSEGSAEAAPELDLFAMKPPETSAPVVTPTASTAPPVPATAPSPAP  516

Query 364  --------------------------------------------------------------------------  363
                                                                                     
Sbjct 517  TAVAATAATTTAAAAATTTATTSAAAATTAAAPPALDIFGDLFDSAPEVAAAPKPDAAPSIDLFGTDAFSSPPR  590

Query 364  -------------------------------------------GGFGGSFMAPSPSPVTPAQNNLLQPNFEAAF  394
                                                      |||||||||||..||||||||||||.|||||
Sbjct 591  GASPVPESSLTADLLSVDAFAAPSPASTASPAKAESSGVIDLFGGFGGSFMAPSTTPVTPAQNNLLQPSFEAAF  664

Query 395  GTTPSTSSSSSFDPSVFDGLGDLLMPTMAPAGQPAPVSMVPPSPAMAASKALGSDLDSSLASLVGNLGISGTTT  468
           ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 665  GTTPSTSSSSSFDPSVFDGLGDLLMPTMAPSGQPAPVSMVPPSPAMAASKGLGSDLDSSLASLVGNLGISGTTS  738

Query 469  KKGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVAPATWSAGVPPSAPLQGAVPPTSSVPPVAGAPSVGQPGAGFGMPPAGTGM  542
           ||||||||||||||||||||||||.||||||||||                                ||.||||
Sbjct 739  KKGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVTPATWSAGVPP--------------------------------PPSGTGM  780

Query 543  PMMPQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPASQSPKKPPAKDPLADLN-----  595
           .||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||     
Sbjct 781  TMMSQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPATQSPKKPPAKDPLADLNIKDFL  838