Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11428
• Subject: XM_030244159.1
• Aligned Length: 1845
• Identities: 1512
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74

Query   75  GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148
            .||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148

Query  149  ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT  222
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG  222

Query  223  GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC  296
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC  296

Query  297  TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA  370

Query  371  TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG  444
            ||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG  444

Query  445  AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG  518
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG  518

Query  519  ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA  592
            .||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA  592

Query  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT  666

Query  667  TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT  740
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct  667  TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT  740

Query  741  GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA  772
            |||||||||.||||||||.|                                          ||.|||||||||
Sbjct  741  GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA  814

Query  773  GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT  846
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT  888

Query  847  CCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATTGA  920
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATCGA  962

Query  921  CACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCATCTAGTG  994
            |||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCATCAAGCG  1036

Query  995  ATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGAGGGGCAGCAGCAGCCGCAGCACCAGCACC---ACCACCA  1065
            |||||||.||.||.|||||.|||||   ||||||      ||||||.||.|..|||.|||||||   |...||.
Sbjct 1037  ATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGG------AGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCT  1101

Query 1066  CCTGCTGGAGGAGCCACTGCATGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCC  1139
            |||.||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.|.|||||||||||
Sbjct 1102  CCTTCTGGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCC  1175

Query 1140  AGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGGCAGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCT  1213
            ||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1176  AGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGGCAGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCT  1249

Query 1214  CCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGATCTTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCA  1287
            |.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.
Sbjct 1250  CTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGATCTTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCC  1323

Query 1288  CCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCT  1361
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1324  CCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCT  1397

Query 1362  TGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTACCACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAG  1435
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1398  GGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTACCACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGG  1471

Query 1436  AGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCTAAAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCA  1509
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||.|| 
Sbjct 1472  AGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCGAAAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC-  1544

Query 1510  AGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAGTTCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACA  1583
                                                                                      
Sbjct 1545  --------------------------------------------------------------------------  1544

Query 1584  ACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGACAGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTG  1657
                                 |||||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1545  ---------------------GCCTCCTTCAGGGACAGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTG  1597

Query 1658  CACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCCGCTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCT  1731
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598  CACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCAGCTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCT  1671

Query 1732  GCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGACCCATTAGCGGATCTTAAC---------------  1785
            ||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||               
Sbjct 1672  GCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGACCCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTTG  1740