Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11459
• Subject: NM_001017392.5
• Aligned Length: 1104
• Identities: 947
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------MYDDVHSDGRYSLSGSVAHSRD  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MAARRITQETFDAVLQEKAKRYHMDASGEAVSETLQFKAQDLLRAVPRSRAEMYDDVHSDGRYSLSGSVAHSRD  74

Query   23  AGREGLRSDVFPGPSFRSSNPSISDDSYFRKECGRDLEFSHSDSRDQVIGHRKLGHFRSQDWKFALRGSWEQDF  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGREGLRSDVFPGPSFRSSNPSISDDSYFRKECGRDLEFSHSDSRDQVIGHRKLGHFRSQDWKFALRGSWEQDF  148

Query   97  GHPVSQESSWSQEYSFGPSAVLGDFGSSRLIEKECLEKESRDYDVDHPGEADSVLRGSSQVQARGRALNIVDQE  170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  GHPVSQESSWSQEYSFGPSAVLGDFGSSRLIEKECLEKESRDYDVDHPGEADSVLRGGSQVQARGRALNIVDQE  222

Query  171  GSLLGKGETQGLLTAKGGVGKLVTLRNVSTKKIPTVNRITPKTQGTNQIQKNTPSPDVTLGTNPGTEDIQFPIQ  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GSLLGKGETQGLLTAKGGVGKLVTLRNVSTKKIPTVNRITPKTQGTNQIQKNTPSPDVTLGTNPGTEDIQFPIQ  296

Query  245  KIPLGLDLKNLRLPRRKMSFDIIDKSDVFSRFGIEIIKWAGFHTIKDDIKFSQLFQTLFELETETCAKMLASFK  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  KIPLGLDLKNLRLPRRKMSFDIIDKSDVFSRFGIEIIKWAGFHTIKDDIKFSQLFQTLFELETETCAKMLASFK  370

Query  319  CSLKPEHRDFCFFTIKFLKHSALKTPRVDNEFLNMLLDKGAVKTKNCFFEIIKPFDKYIMRLQDRLLKSVTPLL  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CSLKPEHRDFCFFTIKFLKHSALKTPRVDNEFLNMLLDKGAVKTKNCFFEIIKPFDKYIMRLQDRLLKSVTPLL  444

Query  393  MACNAYELSVKMKTLSNPLDLALALETTNSLCRKSLALLGQTFSLASSFRQEKILEAVGLQDIAPSPAAFPNFE  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  MACNAYELSVKMKTLSNPLDLALALETTNSLCRKSLALLGQTFSLASSFRQEKILEAVGLQDIAPSPAAFPNFE  518

Query  467  DSTLFGREYIDHLKAWLVSSGCPLQVKKAEPEPMREEEKMIPPTKPEIQAKAPSSLSDAVPQRADHRVVGTIDQ  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  DSTLFGREYIDHLKAWLVSSGCPLQVKKAEPEPMREEEKMIPPTKPEIQAKAPSSLSDAVPQRADHRVVGTIDQ  592

Query  541  LVKRVIEGSLSPKERTLLKEDPAYWFLSDENSLEYKYYKLKLAEMQRMSENLRGADQKPTSADCAVRAMLYSRA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  LVKRVIEGSLSPKERTLLKEDPAYWFLSDENSLEYKYYKLKLAEMQRMSENLRGADQKPTSADCAVRAMLYSRA  666

Query  615  VRNLKKKLLPWQRRGLLRAQGLRGWKARRATTGTQTLLSSGTRLKHHGRQAPGLSQAKPSLPDRNDAAKDCPPD  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  VRNLKKKLLPWQRRGLLRAQGLRGWKARRATTGTQTLLSSGTRLKHHGRQAPGLSQAKPSLPDRNDAAKDCPPD  740

Query  689  PVGPSPQDPSLEASGPSPKPAGVDISEAPQTSSPCPSADIDMKTMETAEKLARFVAQVGPEIEQFSIENSTDNP  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  PVGPSPQDPSLEASGPSPKPAGVDISEAPQTSSPCPSADIDMKTMETAEKLARFVAQVGPEIEQFSIENSTDNP  814

Query  763  DLWFLHDQNSSAFKFYRKKVFELCPSICFTSSPHNLHTGGGDTTGSQESPVDLMEGEAEFEDEPPPREAELESP  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  DLWFLHDQNSSAFKFYRKKVFELCPSICFTSSPHNLHTGGGDTTGSQESPVDLMEGEAEFEDEPPPREAELESP  888

Query  837  E----------------------------------------------------ASSGTCFPRKRISSKSLKVGM  858
            |                                                    |||||||||||||||||||||
Sbjct  889  EVMPEEEDEDDEDGGEEAPAPGGAGKSEGSTPADGLPGEAAEDDLAGAPALSQASSGTCFPRKRISSKSLKVGM  962

Query  859  IPAPKRVCLIQEPKVHEPVRIAYDRPRGRPMSKKKKPKDLDFAQQKLTDKNLGFQMLQKMGWKEGHGLGSLGKG  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  IPAPKRVCLIQEPKVHEPVRIAYDRPRGRPMSKKKKPKDLDFAQQKLTDKNLGFQMLQKMGWKEGHGLGSLGKG  1036

Query  933  IREPVSV------YAAGSLGWEWVGPQSFHLQPAAWLLHSQDGLQLAVDFCFLNRRHLQMRS------  988
            |||||||      ...|..|.|                |..|      .|.....|..||..      
Sbjct 1037  IREPVSVGTPSEGEGLGADGQE----------------HKED------TFDVFRQRMMQMYRHKRANK  1082