Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11482
- Subject:
- NM_001301868.1
- Aligned Length:
- 1554
- Identities:
- 1236
- Gaps:
- 162
Alignment
Query 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA 74
Query 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
|||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 75 TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG 148
Query 149 ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT 222
|..|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCGAGGCATGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT 222
Query 223 GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA 296
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA 296
Query 297 AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA 370
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA 370
Query 371 TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT 444
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 371 TCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAAC 444
Query 445 CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT 518
|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 445 CAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTT 518
Query 519 CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC---- 588
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTG 592
Query 589 -------------------------------------------------------------------------- 588
Sbjct 593 GTAAGCCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGGAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAGCATAAAGAGCGA 666
Query 589 ---------------------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGA 617
||||||||.|||||||||||.||||..||
Sbjct 667 TGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCATGTACCCAGTCATTAAGGAAGAAACTAACCACAACGA 740
Query 618 AATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCA 691
.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 741 GATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTGGACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCA 814
Query 692 AACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCC 765
||| |.||||||.|||||||.||||.||||||.|| |||.|||
Sbjct 815 AAC------------------------------GAGACAAGTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA---CAGTGCC 855
Query 766 AGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCT 839
|.|||.||||||||| ||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 856 AACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGGCCATCAACAATGCCATCAACTACCT 926
Query 840 GGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGA 913
||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct 927 GGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCA 1000
Query 914 TGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAG 987
|||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||.||.||.||||| |||||||||.
Sbjct 1001 TGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCATTCAGCACAGGA---CGCCGTGGAT 1071
Query 988 AACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGA 1061
|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 AACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGA 1145
Query 1062 CTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGC 1135
||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||..|||||
Sbjct 1146 CTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATCTACCTAACCAACCACATCAACCCGC 1219
Query 1136 ACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCG 1209
|.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1220 ATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCG 1293
Query 1210 CAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCT 1283
|||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1294 CAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCT 1367
Query 1284 CTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGT 1357
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1368 CTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGT 1441
Query 1358 GCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1431
|.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1442 GTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC 1515