Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11482
• Subject: XM_006514680.3
• Aligned Length: 1562
• Identities: 1170
• Gaps: 250

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
                                                                                     |
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------------------A  1

Query   75  T-GAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCC----ACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAA  143
            | ||.||||      |||| ||.|         ||.|||.|    |.||..| ||||||               
Sbjct    2  TGGAAGGCG------CCAT-CCTA---------ACTTCTTCTGTGAGCAGGT-GGGAGG---------------  43

Query  144  GAGTGACAGAGTCGTG---GCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTG  214
            ||     ||||.||.|   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  GA-----AGAGACGCGAGAGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTG  112

Query  215  AAATGAATGGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCAC  288
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  AAATGAATGGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCAC  186

Query  289  AGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATAT  362
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  AGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATAT  260

Query  363  CTGTGGGATCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCC  436
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  261  CTGTGGGATCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCC  334

Query  437  AGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAG  510
            |||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  335  AGTGCAACCAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAG  408

Query  511  AAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCA  584
            |||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  409  AAGCCCTTCAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCA  482

Query  585  CTCC----------------------------------------------------------------------  588
            ||||                                                                      
Sbjct  483  CTCCGTTGGTAAGCCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGGAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAGCATA  556

Query  589  -----------------------------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAAT  609
                                                                 ||||||||.|||||||||||.
Sbjct  557  AAGAGCGATGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCATGTACCCAGTCATTAAGGAAGAAACTAAC  630

Query  610  CACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAA  683
            ||||..||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct  631  CACAACGAGATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTGGACAGGCTGGCAAGCAA  704

Query  684  CGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACA  757
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||.||||||.||  
Sbjct  705  TGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAAGTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA--  776

Query  758  GCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATC  831
             |||.||||.|||.|||||||||   ||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  777  -CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGGCCATCAACAATGCCATC  846

Query  832  AACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCAT  905
            ||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  847  AACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCAT  920

Query  906  CAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCG  979
            ||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||.||.||.|||||   ||
Sbjct  921  CAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCATTCAGCACAGGA---CG  991

Query  980  CCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGC  1053
            |||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  992  CCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGC  1065

Query 1054  TGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACAT  1127
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1066  TGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATCTACCTAACCAACCACAT  1139

Query 1128  CGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCG  1201
            |..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.|||||.|
Sbjct 1140  CAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAG  1213

Query 1202  AGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGC  1275
            |||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214  AGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGC  1287

Query 1276  CGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTG  1349
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1288  CGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTG  1361

Query 1350  CAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCC  1423
            .||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|.||
Sbjct 1362  TAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACC  1435

Query 1424  ACATGAGC  1431
            ||.|||||
Sbjct 1436  ACCTGAGC  1443