Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11482
- Subject:
- XM_011243712.2
- Aligned Length:
- 1431
- Identities:
- 1266
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA 74
Query 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
|||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 75 TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG 148
Query 149 ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT 222
|..|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCGAGGCATGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT 222
Query 223 GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA 296
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA 296
Query 297 AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA 370
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA 370
Query 371 TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT 444
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 371 TCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAAC 444
Query 445 CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT 518
|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 445 CAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTT 518
Query 519 CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA 592
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA 592
Query 593 TTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTG 666
||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.|||
Sbjct 593 TTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTG 666
Query 667 GACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTC 740
|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 667 GACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAAGTGCCTGTC 740
Query 741 CGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAG 814
.||||.||||||.|| |||.||||.|||.||||||||| ||.|||||||..|||||||||||||||||.|
Sbjct 741 AGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGG 808
Query 815 CCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCC 888
||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||
Sbjct 809 CCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCC 882
Query 889 GAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCA 962
||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||
Sbjct 883 GAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCA 956
Query 963 CTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGG 1036
.||.||.||||| |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.||||
Sbjct 957 TTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGG 1027
Query 1037 CGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATC 1110
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1028 CCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATC 1101
Query 1111 TACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCT 1184
|||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct 1102 TACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGT 1175
Query 1185 GCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGT 1258
||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 1176 GCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGT 1249
Query 1259 ACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTC 1332
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1250 ACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTT 1323
Query 1333 CGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCG 1406
||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1324 CGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCG 1397
Query 1407 AGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1431
.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1398 GGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC 1422