Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11482
• Subject: XM_011243713.2
• Aligned Length: 1491
• Identities: 1145
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA  74

Query   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148
            |||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct   75  TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG  148

Query  149  ACAGAGTCGTGG------------------------------------------------------------CC  162
            |..|||.|.|||                                                            ||
Sbjct  149  ATCGAGGCATGGTTGCATATGGGGCTGATGGCTTTAGGGATTTTCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCC  222

Query  163  AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC  296

Query  237  GGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT  310
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT  370

Query  311  TGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGG  384
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  371  TGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCGTTTGCATCGGG  444

Query  385  CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTC  458
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAACCAGTGTGGGGCCTC  518

Query  459  ATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCT  532
            .||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  CTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTTCAAATGCCATCTTT  592

Query  533  GCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCATTAAAGAAGAAACT  606
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||                  
Sbjct  593  GCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCC------------------  648

Query  607  AATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAG  680
                                                                                      
Sbjct  649  --------------------------------------------------------------------------  648

Query  681  TAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACG  754
                                                       ||.||||||.|||||||.||||.||||||.|
Sbjct  649  -------------------------------------------GGAGACAAGTGCCTGTCAGACATGCCCTATG  679

Query  755  ACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCC  828
            |   |||.||||.|||.|||||||||   ||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  680  A---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGGCCATCAACAATGCC  747

Query  829  ATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGT  902
            |||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.||
Sbjct  748  ATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGT  821

Query  903  CATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACA  976
            |||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||.||.||.|||||  
Sbjct  822  CATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCATTCAGCACAGGA--  893

Query  977  GCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAAC  1050
             |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  894  -CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAAC  966

Query 1051  AGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCA  1124
            |||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  967  AGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATCTACCTAACCAACCA  1040

Query 1125  CATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCT  1198
            ||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.||||
Sbjct 1041  CATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCT  1114

Query 1199  CCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACAC  1272
            |.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  CAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGTACAAGTGCGAACAC  1188

Query 1273  TGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGA  1346
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1189  TGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGA  1262

Query 1347  GTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCT  1420
            |||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1263  GTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCGGGGGGAGCATCGTT  1336

Query 1421  TCCACATGAGC  1431
            .||||.|||||
Sbjct 1337  ACCACCTGAGC  1347