Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11482
• Subject: XM_011515059.3
• Aligned Length: 1689
• Identities: 1401
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                    ||
Sbjct    1  ATGGAAGGCGCCATCCTAACTTCTGCCGTGAGCAGGTGGGAGGGAAGAGAGACGAGAGATAACCTGAGGACCAT  74

Query    3  GGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATG  76
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATG  148

Query   77  AGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGAC  150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGAC  222

Query  151  AGAGTCGTGG------------------------------------------------------------CCAG  164
            ||||||||||                                                            ||||
Sbjct  223  AGAGTCGTGGTTACATATGGGGCTGATGACTTTAGGGATTTCCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCCAG  296

Query  165  TAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGG  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGG  370

Query  239  AGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTG  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTG  444

Query  313  TCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCC  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCC  518

Query  387  CAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCAT  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCAT  592

Query  461  TCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGC  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGC  666

Query  535  AACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC--------------------  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  667  AACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTGGTAAACCTCACAAATG  740

Query  589  --------------------------------------------------------------------------  588
                                                                                      
Sbjct  741  TGGATATTGTGGCCGAAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAACATAAAGAGCGCTGCCACAACTACTTGG  814

Query  589  --------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGAC  630
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGCATGGGCCTTCCGGGCACACTGTACCCAGTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGAC  888

Query  631  CTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTC  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  889  CTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAAC----------  952

Query  705  TATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGG  778
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  --------------------GGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGG  1006

Query  779  AGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCC  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  AGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCC  1080

Query  853  CTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCA  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  CTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCA  1154

Query  927  CAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGC  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  CAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGC  1228

Query 1001  TCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACC  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  TCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACC  1302

Query 1075  GAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGG  1148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  GAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGG  1376

Query 1149  GCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCC  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  GCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCC  1450

Query 1223  GCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCAC  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  GCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCAC  1524

Query 1297  GTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAG  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  GTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAG  1598

Query 1371  CCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599  CCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1659