Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11484
- Subject:
- NM_001144896.2
- Aligned Length:
- 1212
- Identities:
- 1012
- Gaps:
- 123
Alignment
Query 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT 74
Query 75 CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGC-------------------------------------------- 104
Query 149 TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 ----------------------------AGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA 150
Query 223 GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA 224
Query 297 GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 225 GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT 298
Query 371 ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG 372
Query 445 GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCT 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCT 446
Query 519 GACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGG 592
|||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 447 GACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCC 520
Query 593 AGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTG 666
.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 521 GGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTG 594
Query 667 AAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGAC 740
||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|
Sbjct 595 AAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGC 668
Query 741 TGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA 814
||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 TGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA 742
Query 815 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACT 888
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 743 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGT 816
Query 889 GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 817 GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCT 890
Query 963 AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|
Sbjct 891 AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAG 964
Query 1037 GAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGAC 1110
||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|.
Sbjct 965 GAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAAT 1038
Query 1111 GTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA-------------------- 1161
.|||.|||.|.||||||||||||||||.|||||| ||||||.|||.||.|||
Sbjct 1039 CTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGC 1112
Query 1162 ---------------------------- 1161
Sbjct 1113 CCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG 1140