Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11484
- Subject:
- NM_001144897.2
- Aligned Length:
- 1212
- Identities:
- 1066
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT 74
Query 75 CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT 148
Query 149 TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA 222
Query 223 GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA 296
Query 297 GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT 370
Query 371 ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG 444
Query 445 GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCT 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCT 518
Query 519 GACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGG 592
|||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 519 GACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCC 592
Query 593 AGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTG 666
.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 593 GGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTG 666
Query 667 AAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGAC 740
||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|
Sbjct 667 AAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGC 740
Query 741 TGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA 814
||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA 814
Query 815 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACT 888
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 815 ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGT 888
Query 889 GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCT 962
|||||||| ||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 GCTGAGGA------------------GCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCT 944
Query 963 AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|
Sbjct 945 AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAG 1018
Query 1037 GAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGAC 1110
||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|.
Sbjct 1019 GAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAAT 1092
Query 1111 GTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA-------------------- 1161
.|||.|||.|.||||||||||||||||.|||||| ||||||.|||.||.|||
Sbjct 1093 CTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGC 1166
Query 1162 ---------------------------- 1161
Sbjct 1167 CCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG 1194