Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11497
• Subject: XM_011537462.2
• Aligned Length: 2722
• Identities: 2168
• Gaps: 551

Alignment

Query    1  ATGGCGACCCCGGACCAGAAGTCGCCGAACGTTCTGCTGCAGAACCTGTGCTGCAGGATCCTGGGCAGGAGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACCCCGGACCAGAAGTCGCCGAACGTTCTGCTGCAGAACCTGTGCTGCAGGATCCTGGGCAGGAGCGA  74

Query   75  AGCTGATGTAGCCCAGCAGTTCCAGTATGCTGTGCGGGTGATTGGCAGCAACTTCGCCCCAACTGTTGAAAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCTGATGTAGCCCAGCAGTTCCAGTATGCTGTGCGGGTGATTGGCAGCAACTTCGCCCCAACTGTTGAAAGAG  148

Query  149  ATGAATTTTTAGTAGCTGAAAAAATCAAGAAAGAGCTTATTCGACAACGAAGAGAAGCAGATGCTGCATTATTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAATTTTTAGTAGCTGAAAAAATCAAGAAAGAGCTTATTCGACAACGAAGAGAAGCAGATGCTGCATTATTT  222

Query  223  TCAGAACTCCACAGAAAACTTCATTCACAGGGAGTTTTGAAAAATAAATGGTCAATACTCTACCTCTTGCTGAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGAACTCCACAGAAAACTTCATTCACAGGGAGTTTTGAAAAATAAATGGTCAATACTCTACCTCTTGCTGAG  296

Query  297  CCTCAGTGAGGACCCACGCAGGCAGCCAAGCAAGGTTTCTAGCTATGCTACGTTATTTGCTCAGGCCTTACCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTCAGTGAGGACCCACGCAGGCAGCCAAGCAAGGTTTCTAGCTATGCTACGTTATTTGCTCAGGCCTTACCAA  370

Query  371  GAGATGCCCACTCAACCCCTTACTACTATGCCAGGCCTCAGACCCTTCCCCTGAGCTACCAAGATCGGAGTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGATGCCCACTCAACCCCTTACTACTATGCCAGGCCTCAGACCCTTCCCCTGAGCTACCAAGATCGGAGTGCC  444

Query  445  CAGTCAGCCCAGAGCTCCGGCAGCGTGGGCAGCAGTGGCATCAGCAGCATTGGCCTGTGTGCCCTCAGTGGCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCAGCCCAGAGCTCCGGCAGCGTGGGCAGCAGTGGCATCAGCAGCATTGGCCTGTGTGCCCTCAGTGGCCC  518

Query  519  CGCGCCTGCGCCACAATCTCTCCTCCCAGGACAGTCTAATCAAGCTCCAGGAGTAGGAGATTGCCTTCGACAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGCGCCTGCGCCACAATCTCTCCTCCCAGGACAGTCTAATCAAGCTCCAGGAGTAGGAGATTGCCTTCGACAGC  592

Query  593  AGTTGGGGTCACGACTCGCATGGACTTTAACTGCAAATCAGCCTTCTTCACAAGCCACTACCTCAAAAGGTGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTTGGGGTCACGACTCGCATGGACTTTAACTGCAAATCAGCCTTCTTCACAAGCCACTACCTCAAAAGGTGTC  666

Query  667  CCCAGTGCTGTGTCTCGCAACATGACAAGGTCCAGGAGAGAAGGGGATACGGGTGGTACTATGGAAATTACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAGTGCTGTGTCTCGCAACATGACAAGGTCCAGGAGAGAAGGGGATACGGGTGGTACTATGGAAATTACAGA  740

Query  741  AGCAGCTCTGGTAAGGGACATTTTGTACGTCTTTCAGGGCATAGATGGCAAAAACATCAAAATGAACAACACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCAGCTCTGGTAAGGGACATTTTGTACGTCTTTCAGGGCATAGATGGCAAAAACATCAAAATGAACAACACTG  814

Query  815  AAAATTGTTACAAAGTAGAAGGAAAGGCAAATCTAAGTAGGTCTTTGAGAGACACAGCAGTCAGGCTTTCTGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAATTGTTACAAAGTAGAAGGAAAGGCAAATCTAAGTAGGTCTTTGAGAGACACAGCAGTCAGGCTTTCTGAG  888

Query  889  TTGGGATGGTTGCATAATAAAATCAGAAGATACACGGACCAGAGGAGCCTGGACCGCTCATTCGGACTCGTCGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGGATGGTTGCATAATAAAATCAGAAGATACACGGACCAGAGGAGCCTGGACCGCTCATTCGGACTCGTCGG  962

Query  963  GCAGAGCTTTTGTGCTGCCTTGCACCAGGAACTCAGAGAATACTATCGATTGCTCTCTGTTTTACATTCTCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  963  GCAGAGCTTTTGTGCTGCCTTGCACCAGGAACTCAGAGAATACTATCGATTGCTCTCTGTTTTACATTCTCAG-  1035

Query 1037  TACAACTAGAGGATGACCAGGGTGTGAATTTGGGACTTGAGAGTAGTTTAACACTTCGGCGCCTCCTGGTTTGG  1110
                                                                                      
Sbjct 1036  --------------------------------------------------------------------------  1035

Query 1111  ACCTATGATCCCAAAATACGACTGAAGACCCTTGCGGCCCTAGTGGACCACTGCCAAGGAAGGAAAGGAGGTGA  1184
                                                                                      
Sbjct 1036  --------------------------------------------------------------------------  1035

Query 1185  GCTGGCCTCAGCTGTCCACGCCTACACAAAAACAGGAGACCCGTACATGCGGTCTCTGGTGCAGCACATCCTCA  1258
                                                                                      
Sbjct 1036  --------------------------------------------------------------------------  1035

Query 1259  GCCTCGTGTCTCATCCTGTTTTGAGCTTCCTGTACCGCTGGATATATGATGGGGAGCTTGAGGACACTTACCAC  1332
                                                                                      
Sbjct 1036  --------------------------------------------------------------------------  1035

Query 1333  GAATTTTTTGTAGCATCAGATCCAACAGTTAAAACAGATCGACTGTGGCACGACAAGTATACTTTGAGGAAATC  1406
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  ---TTTTTTGTAGCATCAGATCCAACAGTTAAAACAGATCGACTGTGGCACGACAAGTATACTTTGAGGAAATC  1106

Query 1407  GATGATTCCTTCGTTTATGACGATGGATCAGTCTAGGAAGGTCCTTTTGATAGGAAAATCAATAAATTTCTTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  GATGATTCCTTCGTTTATGACGATGGATCAGTCTAGGAAGGTCCTTTTGATAGGAAAATCAATAAATTTCTTGC  1180

Query 1481  ACCAAGTTTGTCATGATCAGACTCCCACTACAAAGATGATAGCTGTGACCAAGTCTGCAGAGTCACCCCAGGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  ACCAAGTTTGTCATGATCAGACTCCCACTACAAAGATGATAGCTGTGACCAAGTCTGCAGAGTCACCCCAGGAC  1254

Query 1555  GCTGCAGACCTATTCACAGACTTGGAAAATGCATTTCAGGGGAAGATTGATGCTGCTTATTTTGAGACCAGCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  GCTGCAGACCTATTCACAGACTTGGAAAATGCATTTCAGGGGAAGATTGATGCTGCTTATTTTGAGACCAGCAA  1328

Query 1629  ATACCTGTTGGATGTTCTCAATAAAAAGTACAGCTTGCTGGACCACATGCAGGCAATGAGGCGGTACCTGCTTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  ATACCTGTTGGATGTTCTCAATAAAAAGTACAGCTTGCTGGACCACATGCAGGCAATGAGGCGGTACCTGCTTC  1402

Query 1703  TTGGTCAAGGAGACTTTATAAGGCACTTAATGGACTTGCTAAAACCAGAACTTGTCCGTCCAGCTACGACTTTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TTGGTCAAGGAGACTTTATAAGGCACTTAATGGACTTGCTAAAACCAGAACTTGTCCGTCCAGCTACGACTTTG  1476

Query 1777  TATCAGCATAACTTGACTGGAATTCTAGAAACCGCTGTCAGAGCCACCAACGCACAGTTTGACAGTCCTGAGAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  TATCAGCATAACTTGACTGGAATTCTAGAAACCGCTGTCAGAGCCACCAACGCACAGTTTGACAGTCCTGAGAT  1550

Query 1851  CCTGCGAAGGCTGGACGTGCGGCTGCTGGAGGTCTCTCCAGGTGACACTGGATGGGATGTCTTCAGCCTCGATT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  CCTGCGAAGGCTGGACGTGCGGCTGCTGGAGGTCTCTCCAGGTGACACTGGATGGGATGTCTTCAGCCTCGATT  1624

Query 1925  ATCATGTTGACGGACCAATTGCAACTGTGTTTACTCGAGAATGTATGAGCCACTACCTAAGAGTATTTAACTTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  ATCATGTTGACGGACCAATTGCAACTGTGTTTACTCGAGAATGTATGAGCCACTACCTAAGAGTATTTAACTTC  1698

Query 1999  CTCTGGAGGGCGAAGCGGATGGAATACATCCTCACTGACATACGGAAGGGACACATGTGCAATGCAAAGCTCCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  CTCTGGAGGGCGAAGCGGATGGAATACATCCTCACTGACATACGGAAGGGACACATGTGCAATGCAAAGCTCCT  1772

Query 2073  GAGAAACATGCCAGAGTTCTCCGGGGTGCTGCACCAGTGTCACATTTTGGCCTCTGAGATGGTCCATTTCATTC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  GAGAAACATGCCAGAGTTCTCCGGGGTGCTGCACCAGTGTCACATTTTGGCCTCTGAGATGGTCCATTTCATTC  1846

Query 2147  ATCAGATGCAGTATTACATCACATTTGAGGTGCTTGAATGTTCTTGGGATGAGCTTTGGAACAAAGTCCAGCAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  ATCAGATGCAGTATTACATCACATTTGAGGTGCTTGAATGTTCTTGGGATGAGCTTTGGAACAAAGTCCAGCAG  1920

Query 2221  GCCCAGGATTTGGATCACATCATTGCTGCACACGAGGTGTTCTTAGACACCATCATCTCCCGCTGCCTGCTGGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  GCCCAGGATTTGGATCACATCATTGCTGCACACGAGGTGTTCTTAGACACCATCATCTCCCGCTGCCTGCTGGA  1994

Query 2295  CAGTGACTCCAGGGCACTTTTAAATCAACTTAGAGCTGTGTTTGATCAAATTATTGAACTTCAGAATGCTCAAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  CAGTGACTCCAGGGCACTTTTAAATCAACTTAGAGCTGTGTTTGATCAAATTATTGAACTTCAGAATGCTCAAG  2068

Query 2369  ATGCAATATACAGAGCTGCTCTGGAAGAATTGCAGAGACGATTACAGTTTGAAGAGAAAAAGAAACAGCGTGAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  ATGCAATATACAGAGCTGCTCTGGAAGAATTGCAGAGACGATTACAGTTTGAAGAGAAAAAGAAACAGCGTGAA  2142

Query 2443  ATTGAG-----GTTGAGATGTG---------------------------------------------------C  2460
            ||||||     ||.|.|| |||                                                   .
Sbjct 2143  ATTGAGGGCCAGTGGGGA-GTGACGGCAGCAGAGGAAGAGGAGGAAAATAAGAGGATTGGAGAATTTAAAGAAT  2215

Query 2461  CTATAC--------TGC-----GTT-------------------------------------------------  2472
            ||||||        |||     |||                                                 
Sbjct 2216  CTATACCAAAAATGTGCTCACAGTTGCGAATATTGACCCATTTCTACCAGGGTATCGTGCAGCAGTTTTTGGTG  2289

Query 2473  --------------------------------------------------------------------------  2472
                                                                                      
Sbjct 2290  TTACTGACGACCAGCTCTGACGAGAGTCTTCGGTTTCTTAGCTTCAGGCTGGACTTCAACGAGCATTACAAAGC  2363

Query 2473  ----------------------------------------------------------  2472
                                                                      
Sbjct 2364  CAGGGAGCCCAGGCTCCGTGTGTCTCTGGGTACCAGGGGGCGGCGCAGCTCCCACACG  2421