Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11547
Subject:
NM_001330057.1
Aligned Length:
585
Identities:
524
Gaps:
58

Alignment

Query   1  -----------------------MSRVHGMHPKETTRQLSLAVKDGLIVETLTVGCKGSKAGIEQEGYWLPGDE  51
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MVIFTSLHRYVIFISCIIVINWYMSRVHGMHPKETTRQLSLAVKDGLIVETLTVGCKGSKAGIEQEGYWLPGDE  74

Query  52  IDWETENHDWYCFECHLPGEVLICDLCFRVYHSKCLSDEFRLRDSSSPWQCPVCRSIKKKNTNKQEMGTYLRFI  125
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  IDWETENHDWYCFECHLPGEVLICDLCFRVYHSKCLSDEFRLRDSSSPWQCPVCRSIKKKNTNKQEMGTYLRFI  148

Query 126  VSRMKERAIDLNKKGKDNKHPMYRRLVHSAVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYG-DSEQAD  198
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 149  VSRMKERAIDLNKKGKDNKHPMYRRLVHSAVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQAD  222

Query 199  IARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGH  272
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  IARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGH  296

Query 273  HHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWKSKNEDRGEEEAESSISSTSNEQL  346
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  HHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWKSKNEDRGEEEAESSISSTSNEQL  370

Query 347  KVTQEPRAKKGRRNQSVEPKKEEPEPETEAVSSSQEIPTMPQPIEKVSVSTQTKKLSASSPRMLHRSTQTTNDG  420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  KVTQEPRAKKGRRNQSVEPKKEEPEPETEAVSSSQEIPTMPQPIEKVSVSTQTKKLSASSPRMLHRSTQTTNDG  444

Query 421  VCQSMCHDKYTKIFNDFKDRMKSDHKRETERVVREALEKLRSEMEEEKRQAVNKAVANMQGEMDRKCKQVKEKC  494
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  VCQSMCHDKYTKIFNDFKDRMKSDHKRETERVVREALEKLRSEMEEEKRQAVNKAVANMQGEMDRKCKQVKEKC  518

Query 495  KEEFVEEIKKLATQHKQLISQTKKKQWV-------------NTSLF---------------------  527
           |||||||||||||||||||||||||||.             |||..                     
Sbjct 519  KEEFVEEIKKLATQHKQLISQTKKKQWCYNCEEEAMYHCCWNTSYCSIKCQQEHWHAEHKRTCRRKR  585