Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11567
- Subject:
- NM_001300962.2
- Aligned Length:
- 2800
- Identities:
- 2471
- Gaps:
- 329
Alignment
Query 1 ----------------------------------------ATGAGAAGTGGCGATCAAAATTGGGTATCAGTTA 34
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTCCATCCGAGAGAAGCTATGTTTAGCATCTTCTGTCATGAGAAGTGGCGATCAAAATTG----------- 63
Query 35 GCAGAGCAATCAAGCCCTTTGCAGAACCTGGCCGCCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTTCCCAG 108
|||||||||||||||
Sbjct 64 -----------------------------------------------------------CATTGTGCTTCCCAG 78
Query 109 TACTCGGAGCTTTTAGAGACCACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAAACTGT 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 TACTCGGAGCTTTTAGAGACCACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAAACTGT 152
Query 183 TGAAGATGTTATTGTTCGGAAATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAACCCAGG 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 TGAAGATGTTATTGTTCGGAAATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAACCCAGG 226
Query 257 AGAGATATAGACGGCTAAAGAGAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTT 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 227 AGAGATATAGACGGCTAAAGAGAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTT 300
Query 331 TGCAATGACATTGCAACGAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGC 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGCAATGACATTGCAACGAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGC 374
Query 405 ATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 ATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATT 448
Query 479 CTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGGGGTA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 CTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGG---- 518
Query 553 ACCCCCGGGACTTTGCCGAGTACCCCAGTCACCTCGTTTCCTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGCTCTGC 626
Sbjct 519 -------------------------------------------------------------------------- 518
Query 627 ACCCTTAGAAGCCCCCATGACCCCAGTAACAGATGATTCACCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGCAACTC 700
Sbjct 519 -------------------------------------------------------------------------- 518
Query 701 CACCCCCCTCCCCTCTGCTGTCAGAGCTCTTGAAGAAGGGCAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGGTCAAT 774
|||||||
Sbjct 519 -------------------------------------------------------------------GGTCAAT 525
Query 775 GAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCC 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 GAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCC 599
Query 849 CATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGCTCCCA 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGCTCCCA 673
Query 923 CTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGT 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674 CTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGT 747
Query 997 GAGCCTCCAGTTAAACTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCT 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748 GAGCCTCCAGTTAAACTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCT 821
Query 1071 GCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTG 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 GCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTG 895
Query 1145 TTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATC 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 TTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATC 969
Query 1219 AATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGA 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 AATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGA 1043
Query 1293 TGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTG 1366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044 TGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTG 1117
Query 1367 AGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 AGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCA 1191
Query 1441 GTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTAT 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 GTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTAT 1265
Query 1515 CCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTG 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1266 CCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTG 1339
Query 1589 AGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCT 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1340 AGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCT 1413
Query 1663 GCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACC 1736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1414 GCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACC 1487
Query 1737 AGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTG 1810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 AGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTG 1561
Query 1811 CCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCA 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 CCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCA 1635
Query 1885 TCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATT 1958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1636 TCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATT 1709
Query 1959 GAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTG 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1710 GAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTG 1783
Query 2033 TCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAAT 2106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1784 TCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAAT 1857
Query 2107 GAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGA 2180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 GAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGA 1931
Query 2181 CTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGA 2254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1932 CTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGA 2005
Query 2255 AAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAG 2328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2006 AAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAG 2079
Query 2329 CCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAA 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2080 CCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAA 2153
Query 2403 AAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTG 2476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 AAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTG 2227
Query 2477 TAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATC 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2228 TAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATC 2301
Query 2551 CAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAG 2624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2302 CAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAG 2375
Query 2625 AGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTC 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2376 AGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTC 2449
Query 2699 TCTTTGATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450 TCTTTGATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG 2511