Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11567
• Subject: NM_001300962.2
• Aligned Length: 927
• Identities: 819
• Gaps: 97

Alignment

Query   1  MRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRP-------PDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVR  67
                            ...|...       ..|.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------MVHPREAMFSIFCHEKWRSKLHCASQYSELLETTETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVR  57

Query  68  KLTAERVEELKKVIKETQERYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCNDIATKKKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQA  141
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  58  KLTAERVEELKKVIKETQERYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCNDIATKKKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQA  131

Query 142  VKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTPTTMEEATSGVTPGTLPSTPVTSFPGIPDTLPPGSAPLEAPM  215
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct 132  VKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTPTTMEEATSG--------------------------------  173

Query 216  TPVTDDSPQKKMLGQKATPPPSPLLSELLKKGSLLPTSPRLVNESEMAVASGHLNSTGVLLEVGGVLPMIHGGE  289
                                                    |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174  -----------------------------------------VNESEMAVASGHLNSTGVLLEVGGVLPMIHGGE  206

Query 290  IQQTPNTVAASPAASGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLVPPPVESVSQATIVMMPALPAPSSA  363
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207  IQQTPNTVAASPAASGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLVPPPVESVSQATIVMMPALPAPSSA  280

Query 364  PAVSTTESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSSEISMIINSIKEECFRSGVAEAPVGSKAPSIDGKEELD  437
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281  PAVSTTESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSSEISMIINSIKEECFRSGVAEAPVGSKAPSIDGKEELD  354

Query 438  LAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDK  511
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355  LAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDK  428

Query 512  PVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSAEIKVEPAEPEPVISGAEIVAGVVPATSMEPPELRSQD  585
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429  PVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSAEIKVEPAEPEPVISGAEIVAGVVPATSMEPPELRSQD  502

Query 586  LDEELGSTAAGEIVEADVAIGKGDETPLTNVKTEASPESMLSPSHGSNPIEDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGT  659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503  LDEELGSTAAGEIVEADVAIGKGDETPLTNVKTEASPESMLSPSHGSNPIEDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGT  576

Query 660  IFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSP  733
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577  IFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSP  650

Query 734  ASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGL  807
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651  ASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGL  724

Query 808  IRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQLIMQTSESGISAKSLRGRDSTRKQ  881
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725  IRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQLIMQTSESGISAKSLRGRDSTRKQ  798

Query 882  DASEKDSVPMGSPAFLLSLFDGGTRGRRCAIEADMKMKK  920
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799  DASEKDSVPMGSPAFLLSLFDGGTRGRRCAIEADMKMKK  837