Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11567
Subject:
NM_139199.2
Aligned Length:
1313
Identities:
830
Gaps:
471

Alignment

Query    1  -------------------------------MRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLET  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MATGTGKHKLLSTGPTEPWSIREKLCLASSVMRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLET  74

Query   44  TETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQERYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCNDIATK  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQERYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCNDIATK  148

Query  118  KKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTPTTMEEATSGVTPGTLPS  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  149  KKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTPTTMEEATSG--------  214

Query  192  TPVTSFPGIPDTLPPGSAPLEAPMTPVTDDSPQKKMLGQKATPPPSPLLSELLKKGSLLPTSPRLVNESEMAVA  265
                                                                             |||||||||
Sbjct  215  -----------------------------------------------------------------VNESEMAVA  223

Query  266  SGHLNSTGVLLEVGGVLPMIHGGEIQQTPNTVAASPAASGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLV  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  SGHLNSTGVLLEVGGVLPMIHGGEIQQTPNTVAASPAASGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLV  297

Query  340  PPPVESVSQATIVMMPALPAPSSAPAVSTTESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSSEISMIINSIKEEC  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  PPPVESVSQATIVMMPALPAPSSAPAVSTTESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSSEISMIINSIKEEC  371

Query  414  FRSGVAEAPVGSKAPSIDGKEELDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSF  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  FRSGVAEAPVGSKAPSIDGKEELDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSF  445

Query  488  CEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDKPVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSAEIKVEPAEPEPVI  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  CEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDKPVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSAEIKVEPAEPEPVI  519

Query  562  SGAEIVAGVVPATSMEPPELRSQDLDEELGSTAAGEIVEADVAIGKGDETPLTNVKTEASPESMLSPSHGSNPI  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  SGAEIVAGVVPATSMEPPELRSQDLDEELGSTAAGEIVEADVAIGKGDETPLTNVKTEASPESMLSPSHGSNPI  593

Query  636  EDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSES  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  EDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSES  667

Query  710  DDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIA  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  DDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIA  741

Query  784  PGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQ  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  PGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQ  815

Query  858  LIMQTSESGISAKSLRGRDSTRKQDASEKDSVPMGSPAFLLSLFDGGTRGRRCAIEADMKMKK-----------  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..     ....|.....           
Sbjct  816  LIMQTSESGISAKSLRGRDSTRKQDASEKDSVPMGSPAFLLSLFMGHE-----WVWLDSEQDHPNDSELSNDCR  884

Query  921  --------------------------------------------------------------------------  920
                                                                                      
Sbjct  885  SLFSSWDSSLDLDVGNWRETEDPEAEELEESSPEREPSELLVGDGGSEESQEAARKASHQNLLHFLSEVAYLME  958

Query  921  --------------------------------------------------------------------------  920
                                                                                      
Sbjct  959  PLCISSNESSEGCCPPSGTRQEGREIKASEGERELCRETEELSAKGDPLVAEKPLGENGKPEVASAPSVICTVQ  1032

Query  921  --------------------------------------------------------------------------  920
                                                                                      
Sbjct 1033  GLLTESEEGEAQQESKGEDQGEVYVSEMEDQPPSGECDDAFNIKETPLVDTLFSHATSSKLTDLSQDDPVQDHL  1106

Query  921  --------------------------------------------------------------------------  920
                                                                                      
Sbjct 1107  LFKKTLLPVWKMIASHRFSSPFLKPVSERQAPGYKDVVKRPMDLTSLKRNLSKGRIRTMAQFLRDLMLMFQNAV  1180

Query  921  -------------------------------------------------------  920
                                                                   
Sbjct 1181  MYNDSDHHVYHMAVEMRQEVLEQIQVLNIWLDKRKGSSSLEGEPANPVDDGKPVF  1235