Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- NM_001081442.3
- Aligned Length:
- 1970
- Identities:
- 1479
- Gaps:
- 274
Alignment
Query 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
|||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1 ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC 74
Query 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT 147
|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT 147
Query 148 CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC 219
||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.|||| || |.|||.|.|||
Sbjct 148 CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC 219
Query 220 CCACTGGAACCCAAGAA--CAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGGGAG 284
||||||||.|| .|.| ||||||||..|||..|||.|||||| ||||||| |||.|||.|
Sbjct 220 CCACTGGAGCC--TGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGGGCG 284
Query 285 ATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGAT 358
||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct 285 ATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGAT 358
Query 359 TCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGAT 430
|||| || .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||..|
Sbjct 359 TCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGT 430
Query 431 GTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTG 501
|||...|||.|.|.||| |.|||| .||||||| ||.|| |||| ||||||..||||||||.||||||||
Sbjct 431 GTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTG 498
Query 502 GACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTG 575
.||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||
Sbjct 499 TACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTG 572
Query 576 GAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTC 649
||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 573 GAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTC 646
Query 650 TGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAG--AGCC 721
||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.|||||| |.|.|| ||||
Sbjct 647 TGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCC--GCGGAGGCAGCC 718
Query 722 TGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTC 795
|||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 719 TGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTC 792
Query 796 CAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA 869
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 CAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA 866
Query 870 CGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAAC 942
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 867 CGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGAC 939
Query 943 ATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGG 1013
||||||||.|||||||.||||..||||| ||| ||||.||.|..|||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 940 ATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGG 1010
Query 1014 AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCC 1087
|||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.||||||||||
Sbjct 1011 AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCC 1084
Query 1088 ATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGAC 1160
|||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1085 ATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGAC 1157
Query 1161 CTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTG 1234
|||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|||.
Sbjct 1158 CTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTT 1231
Query 1235 AGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCACAC 1306
|.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| ||||||
Sbjct 1232 ACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCACAC 1303
Query 1307 C---------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAG 1329
| ||||||||||||..||||||.|
Sbjct 1304 CTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGG 1377
Query 1330 GTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCG 1403
|||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1378 GTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCA 1451
Query 1404 TCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGC 1477
|||.|||||||||||||||||.|.|| |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 1452 TCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGC 1513
Query 1478 CCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTG 1551
||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.|||||||||||
Sbjct 1514 CCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTG 1587
Query 1552 AAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC 1625
||||||||||||.|..|||||.||||||||.|||
Sbjct 1588 AAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGG---------------------------------------- 1621
Query 1626 GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC 1699
||||.||
Sbjct 1622 --ATGCTCC----------------------------------------------------------------- 1628
Query 1700 TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG 1773
|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1629 -------------------------------------------------GGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAG 1653
Query 1774 GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG 1847
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1654 GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAG 1727
Query 1848 GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893
|||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1728 GGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC 1773