Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11582
• Subject: XM_011526361.2
• Aligned Length: 2001
• Identities: 1628
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74
            |||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74

Query   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT  147
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT  147

Query  148  CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC  219
            ||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.||||  || |.|||.|.|||
Sbjct  148  CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC  219

Query  220  CCACTGGAACCCAAGAA--CAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGGGAG  284
            ||||||||.||  .|.|  ||||||||..|||..|||.||||||       |||||||       |||.|||.|
Sbjct  220  CCACTGGAGCC--TGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGGGCG  284

Query  285  ATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGAT  358
            ||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct  285  ATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGAT  358

Query  359  TCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGAT  430
            ||||  ||  .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||..|
Sbjct  359  TCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGT  430

Query  431  GTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTG  501
            |||...|||.|.|.|||  |.||||  .||||||| ||.|| ||||   ||||||..||||||||.||||||||
Sbjct  431  GTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTG  498

Query  502  GACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTG  575
            .||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||
Sbjct  499  TACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTG  572

Query  576  GAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTC  649
            ||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  573  GAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTC  646

Query  650  TGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAG--AGCC  721
            ||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||  |.|.||  ||||
Sbjct  647  TGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCC--GCGGAGGCAGCC  718

Query  722  TGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTC  795
            |||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||.||
Sbjct  719  TGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTC  792

Query  796  CAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA  869
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  CAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA  866

Query  870  CGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAAC  942
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  867  CGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGAC  939

Query  943  ATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGG  1013
            ||||||||.|||||||.||||..|||||   |||   ||||.||.|..|||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  940  ATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGG  1010

Query 1014  AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCC  1087
            |||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.||||||||||
Sbjct 1011  AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCC  1084

Query 1088  ATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGAC  1160
            |||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1085  ATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGAC  1157

Query 1161  CTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTG  1234
            |||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|||.
Sbjct 1158  CTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTT  1231

Query 1235  AGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCACAC  1306
            |.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| ||||||
Sbjct 1232  ACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCACAC  1303

Query 1307  CTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTC  1380
            |||||||||||||..||||||.||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1304  CTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTC  1377

Query 1381  TTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCC  1454
            ||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||||||.|.||            |||||.|.|||||
Sbjct 1378  TTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCC  1439

Query 1455  TGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGG  1528
            ||||||||||||||.|.||||||||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1440  TGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGG  1513

Query 1529  AAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGA----CAGTCAGAGCCC  1598
            |.||||..|||.|||||||||||||||||||||||.|..|||||.||||||||.||||    |.| ||||||||
Sbjct 1514  AGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCCG-CAGAGCCC  1586

Query 1599  ACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTC  1672
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1587  ACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTC  1660

Query 1673  CTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACT  1746
            ||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1661  CTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCAGAAGAGGACAGACAGATGGACACT  1734

Query 1747  G-------------------------------------------------------------------------  1747
            |                                                                         
Sbjct 1735  GAGAGAGTCCTTTCCTCTCCAGGCCCCCAGGCCTCCCCCACCCCCACCACGTTCCTTCCCTCTCACTCTCCCCC  1808

Query 1748  -----AGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGA  1816
                 ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1809  GCTGCAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGG  1882

Query 1817  AGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATC  1890
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1883  AGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATC  1956

Query 1891  CAC  1893
            |||
Sbjct 1957  CAC  1959