Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11654
- Subject:
- XM_011533501.1
- Aligned Length:
- 3841
- Identities:
- 2693
- Gaps:
- 1130
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACCCTGACTGAAAGGCTGCGTGAGAAGATATCTCGGGCCTTCTACAACCATGGGCTCCTCTGTGCATCCTA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCCATCCCCATCATCCTCTTCACAGGGTTCTGCATCTTAGCCTGCTGCTACCCACTGCTGAAACTCCCCTTGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAGGAACAGGACCTGTGGAATTCACCACCCCTGTGAAGGATTACTCGCCCCCACCTGTGGACTCTGACCGCAAA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CAAGGAGAGCCTACTGAGCAGCCTGAGTGGTATGTGGGTGCCCCGGTGGCTTATGTCCAGCAGATATTTGTGAA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GTCCTCAGTGTTTCCCTGGCACAAGAACCTCCTGGCAGTAGATGTATTTCGTTCACCTTTGTCCCGGGCATTCC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AACTGGTGGAGGAGATCCGGAACCACGTGCTGAGAGACAGCTCTGGGATCAGGAGCTTGGAGGAGTTGTGTCTG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CAAGTGACCGACCTGCTGCCAGGCCTTAGGAAGCTCAGGAACCTACTCCCTGAGCATGGATGCCTGCTGCTGTC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CCCTGGGAACTTCTGGCAGAATGACTGGGAACGCTTCCATGCTGATCCTGACATCATTGGGACCATCCACCAGC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 ACGAGCCTAAAACCCTGCAGACTTCAGCCACACTCAAAGACTTGTTATTTGGTGTTCCTGGGAAGTACAGCGGG 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GTGAGCCTCTACACCAGGAAGAGGATGGTCTCCTACACCATCACCCTGGTCTTCCAGCACTACCATGCCAAGTT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CCTGGGCAGCCTGCGTGCCCGCCTGATGCTTCTGCACCCCAGCCCCAACTGCAGCCTTCGGGCGGAGAGCCTGG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 TCCACGTGCACTTCAAGGAGGAGATTGGTGTCGCTGAGCTCATCCCCCTTGTGACCACCTACATCATCTTGTTT 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 GCCTACATCTACTTCTCCACGCGGAAGATCGACATGGTCAAGTCCAAGTGGGGGCTGGCCCTGGCTGCCGTGGT 962
Query 1 ----------------------ATGAC------------------------CCTGA--------CTGAAAGGC- 19
|||.| ||||| ||.||.|||
Sbjct 963 CACAGTGCTCAGCTCGCTGCTCATGTCTGTGGGACTCTGCACACTCTTCGGCCTGACGCCCACCCTCAATGGCG 1036
Query 20 -------------------------------TGCGTGAGAAGATATCTCGGGCCT--------------TCTAC 48
||.||.|||..||.|.|.||..|| ||| |
Sbjct 1037 GCGAGATTTTCCCCTACCTTGTGGTGGTTATTGGGTTAGAGAATGTGTTGGTGCTCACCAAGTCTGTGGTCT-C 1109
Query 49 AACCATGGGCT---CCT----------CTGTGCAT---------CCTA---------------TCCCATC---- 81
||||..|| | ||| |||.|.|| |||| | |||||
Sbjct 1110 AACCCCGG--TAGACCTGGAGGTGAAGCTGCGGATCGCCCAAGGCCTAAGCAGCGAGAGCTGGT-CCATCATGA 1180
Query 82 ---------CC-----------CATCATCCTCATCGGCTACTTCACCCTAGTGCCCGCCATCCAGGAGTTCTGT 135
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 AGAACATGGCCACGGAGCTGGGCATCATCCTCATCGGCTACTTCACCCTAGTGCCCGCCATCCAGGAGTTCTGT 1254
Query 136 CTCTTTGCTGTCGTGGGGCTGGTGTCTGACTTCTTCCTTCAGATGCTGTTTTTCACCACTGTCCTGTCCATTGA 209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 CTCTTTGCTGTCGTGGGGCTGGTGTCTGACTTCTTCCTTCAGATGCTGTTTTTCACCACTGTCCTGTCCATTGA 1328
Query 210 CATTCGCCGGATGGAGCTAGCAGACCTGAACAAGCGACTGCCCCCTGAGGCCTGCCTGCCCTCAGCCAAGCCAG 283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CATTCGCCGGATGGAGCTAGCAGACCTGAACAAGCGACTGCCCCCTGAGGCCTGCCTGCCCTCAGCCAAGCCAG 1402
Query 284 TGGGGCAGCCAACGCGCTACGAGCGGCAGCTGGCTGTGAGGCCGTCCACACCCCACACCATCACGTTGCAGCCG 357
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 TGGGACAGCCAACGCGCTACGAGCGGCAGCTGGCTGTGAGGCCGTCCACACCCCACACCATCACGTTGCAGCCG 1476
Query 358 TCTTCCTTCCGAAACCTGCGGCTCCCCAAGAGGCTGCGTGTTGTCTACTTCCTGGCCCGCACCCGCCTGGCACA 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TCTTCCTTCCGAAACCTGCGGCTCCCCAAGAGGCTGCGTGTTGTCTACTTCCTGGCCCGCACCCGCCTGGCACA 1550
Query 432 GCGCCTCATCATGGCTGGCACCGTTGTCTGGATTGGCATCCTGGTATACACAGACCCAGCAGGGCTGCGCAACT 505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 GCGCCTCATCATGGCTGGCACCGTTGTCTGGATTGGCATCCTGGTATACACAGACCCAGCAGGGCTGCGCAACT 1624
Query 506 ACCTCGCTGCCCAGGTGACGGAACAGAGCCCATTGGGTGAGGGAGCCCTGGCTCCCATGCCCGTGCCTAGTGGC 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 ACCTCGCTGCCCAGGTGACGGAACAGAGCCCATTGGGTGAGGGAGCCCTGGCTCCCATGCCCGTGCCTAGTGGC 1698
Query 580 ATGCTGCCCCCCAGCCACCCGGACCCTGCCTTCTCCATCTTCCCACCTGATGCCCCTAAGCTACCTGAGAACCA 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 ATGCTGCCCCCCAGCCACCCGGACCCTGCCTTCTCCATCTTCCCACCTGATGCCCCTAAGCTACCTGAGAACCA 1772
Query 654 GACGTCGCCAGGCGAGTCACCTGAGCGTGGAGGTCCAGCAGAGGTTGTCCATGACAGCCCAGTCCCAGAGGTAA 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 GACGTCGCCAGGCGAGTCACCTGAGCGTGGAGGTCCAGCAGAGGTTGTCCATGACAGCCCAGTCCCAGAGGTAA 1846
Query 728 CCTGGGGGCCTGAGGATGAGGAACTTTGGAGGAAATTGTCCTTCCGCCACTGGCCGACGCTCTTCAGCTATTAC 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 CCTGGGGGCCTGAGGATGAGGAACTTTGGAGGAAATTGTCCTTCCGCCACTGGCCGACGCTCTTCAGCTATTAC 1920
Query 802 AACATCACACTGGCCAAGAGGTACATCAGCCTGCTGCCCGTCATCCCAGTCACGCTCCGCCTGAACCCGAGGGA 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 AACATCACACTGGCCAAGAGGTACATCAGCCTGCTGCCCGTCATCCCAGTCACGCTCCGCCTGAACCCGAGGGA 1994
Query 876 GGCTCTGGAGGGCCGGCACCCTCAGGACGGCCGCAGTGCCTGGCCCCCACCGGGGCCCATACCTGCTGGGCACT 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 GGCTCTGGAGGGCCGGCACCCTCAGGACGGCCGCAGTGCCTGGCCCCCACCGGGGCCCATACCTGCTGGGCACT 2068
Query 950 GGGAAGCAGGACCCAAGGGCCCAGGTGGGGTGCAGGCCCATGGAGACGTCACGCTGTACAAGGTGGCGGCGCTG 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 GGGAAGCAGGACCCAAGGGCCCAGGTGGGGTGCAGGCCCATGGAGACGTCACGCTGTACAAGGTGGCGGCGCTG 2142
Query 1024 GGCCTGGCCACCGGCATCGTCTTGGTGCTGCTGCTGCTCTGCCTCTACCGCGTGCTATGCCCGCGCAACTACGG 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 GGCCTGGCCACCGGCATCGTCTTGGTGCTGCTGCTGCTCTGCCTCTACCGCGTGCTATGCCCGCGCAACTACGG 2216
Query 1098 GCAGCTGGGTGGTGGGCCCGGGCGGCGGAGGCGCGGGGAGCTGCCCTGCGACGACTACGGCTATGCGCCACCCG 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 GCAGCTGGGTGGTGGGCCCGGGCGGCGGAGGCGCGGGGAGCTGCCCTGCGACGACTACGGCTATGCGCCACCCG 2290
Query 1172 AGACGGAGATCGTGCCGCTTGTGCTGCGCGGCCACCTCATGGACATCGAGTGCCTGGCCAGCGACGGCATGCTG 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 AGACGGAGATCGTGCCGCTTGTGCTGCGCGGCCACCTCATGGACATCGAGTGCCTGGCCAGCGACGGCATGCTG 2364
Query 1246 CTGGTGAGCTGCTGCCTGGCAGGCCACATCTGCGTGTGGGACGCGCAGACCGGGGATTGCCTAACGCGCATTCC 1319
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 CTGGTGAGCTGCTGCCTGGCAGGCCACGTCTGCGTGTGGGACGCGCAGACCGGGGATTGCCTAACGCGCATTCC 2438
Query 1320 GCGCCCAG---GGCAGCGCCGGGACAGTGGCGTGGGCAGCGGGCTTGAGGCTCAGGAGAGCTGGGAACGACTTT 1390
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 GCGCCCAGGCAGGCAGCGCCGGGACAGTGGCGTGGGCAGCGGGCTTGAGGCTCAGGAGAGCTGGGAACGACTTT 2512
Query 1391 CAGATGGTGGGAAGGCTGGTCCAGAGGAGCCTGGGGACAGCCCTCCCCTGAGACACCGCCCCCGGGGCCCTCCG 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 CAGATGGTGGGAAGGCTGGTCCAGAGGAGCCTGGGGACAGCCCTCCCCTGAGACACCGCCCCCGGGGCCCTCCG 2586
Query 1465 CCGCCTTCCCTCTTCGGGGACCAGCCTGACCTCACCTGCTTAATTGACACCAACTTTTCAGCGCAGCCTCGGTC 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2587 CCGCCTTCCCTCTTCGGGGACCAGCCTGACCTCACCTGCTTAATTGACACCAACTTTTCAGCGCAGCCTCGGTC 2660
Query 1539 CTCACAGCCCACTCAGCCCGAGCCCCGGCACCGGGCGGTCTGTGGCCGCTCTCGGGACTCCCCAGGCTATGACT 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661 CTCACAGCCCACTCAGCCCGAGCCCCGGCACCGGGCGGTCTGTGGCCGCTCTCGGGACTCCCCAGGCTATGACT 2734
Query 1613 TCAGCTGCCTGGTGCAGCGGGTGTACCAGGAGGAGGGGCTGGCGGCCGTCTGCACACCAGCCCTGCGCCCACCC 1686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735 TCAGCTGCCTGGTGCAGCGGGTGTACCAGGAGGAGGGGCTGGCGGCCGTCTGCACACCAGCCCTGCGCCCACCC 2808
Query 1687 TCGCCTGGGCCGGTGCTGTCCCAGGCCCCTGAGGACGAGGGTGGCTCCCCCGAGAAAGGCTCCCCTTCCCTCGC 1760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2809 TCGCCTGGGCCGGTGCTGTCCCAGGCCCCTGAGGACGAGGGTGGCTCCCCCGAGAAAGGCTCCCCTTCCCTCGC 2882
Query 1761 CTGGGCCCCCAGTGCCGAGGGTTCCATCTGGAGCTTGGAGCTGCAGGGCAACCTCATCGTGGTGGGGCGGAGCA 1834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883 CTGGGCCCCCAGTGCCGAGGGTTCCATCTGGAGCTTGGAGCTGCAGGGCAACCTCATCGTGGTGGGGCGGAGCA 2956
Query 1835 GCGGCCGGCTGGAGGTGTGGGACGCCATTGAAGGGGTGCTGTGCTGCAGCAGCGAGGAGGTCTCCTCAGGCATT 1908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2957 GCGGCCGGCTGGAGGTGTGGGACGCCATTGAAGGGGTGCTGTGCTGCAGCAGCGAGGAGGTCTCCTCAGGCATT 3030
Query 1909 ACCGCTCTGGTGTTCTTGGACAAAAGGATTGTGGCTGCACGGCTCAACGGTTCCCTTGATTTCTTCTCCTTGGA 1982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3031 ACCGCTCTGGTGTTCTTGGACAAAAGGATTGTGGCTGCACGGCTCAACGGTTCCCTTGATTTCTTCTCCTTGGA 3104
Query 1983 GACCCACACTGCCCTCAGCCCCCTGCAGTTTAGAGGGACCCCAGGGCGGGGCAGTTCCCCTGCCTCTCCAGTGT 2056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3105 GACCCACACTGCCCTCAGCCCCCTGCAGTTTAGAGGGACCCCAGGGCGGGGCAGTTCCCCTGCCTCTCCAGTGT 3178
Query 2057 ACAGCAGCAGCGACACAGTGGCCTGTCACCTGACCCACACAGTGCCCTGTGCACACCAAAAACCCATCACAGCC 2130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 ACAGCAGCAGCGACACAGTGGCCTGTCACCTGACCCACACAGTGCCCTGTGCACACCAAAAACCCATCACAGCC 3252
Query 2131 CTGAAAGCCGCTGCTGGGCGCTTGGTGACTGGGAGCCAAGACCACACACTGAGAGTGTTCCGTCTGGAGGACTC 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3253 CTGAAAGCCGCTGCTGGGCGCTTGGTGACTGGGAGCCAAGACCACACACTGAGAGTGTTCCGTCTGGAGGACTC 3326
Query 2205 GTGCTGCCTCTTCACCCTTCAGGGCCACTCAGGGGCCATCACGACCGTGTACATTGACCAGACCATGGTGCTGG 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3327 GTGCTGCCTCTTCACCCTTCAGGGCCACTCAGGGGCCATCACGACCGTGTACATTGACCAGACCATGGTGCTGG 3400
Query 2279 CCAGTGGAGGACAAGATGGGGCCATCTGCCTGTGGGATGTACTGACTGGCAGCCGGGTCAGCCATGTGTTTGCT 2352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3401 CCAGTGGAGGACAAGATGGGGCCATCTGCCTGTGGGATGTACTGACTGGCAGCCGGGTCAGCCATGTGTTTGCT 3474
Query 2353 CACCGTGGGGATGTCACCTCCCTTACCTGTACCACCTCCTGTGTCATCAGCAGTGGCCTGGATGACCTCATCAG 2426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 CACCGTGGGGATGTCACCTCCCTTACCTGTACCACCTCCTGTGTCATCAGCAGTGGCCTGGATGACCTCATCAG 3548
Query 2427 CATCTGGGACCGCAGCACAGGCATCAAGTTCTACTCCATTCAGCAGGACCTGGGCTGTGGTGCAAGCTTGGGTG 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3549 CATCTGGGACCGCAGCACAGGCATCAAGTTCTACTCCATTCAGCAGGACCTGGGCTGTGGTGCAAGCTTGGGTG 3622
Query 2501 TCATCTCAGACAACCTGCTGGTGACTGGCGGCCAGGGCTGTGTCTCCTTTTGGGACCTAAACTACGGGGACCTG 2574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3623 TCATCTCAGACAACCTGCTGGTGACTGGCGGCCAGGGCTGTGTCTCCTTTTGGGACCTAAACTACGGGGACCTG 3696
Query 2575 TTACAGACAGTCTACCTGGGGAAGAACAGTGAGGCCCAGCCTGCCCGCCAGATCCTGGTGCTGGACAACGCTGC 2648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3697 TTACAGACAGTCTACCTGGGGAAGAACAGTGAGGCCCAGCCTGCCCGCCAGATCCTGGTGCTGGACAACGCTGC 3770
Query 2649 CATTGTCTGCAACTTTGGCAGTGAGCTCAGCCTGGTGTATGTGCCCTCTGTGCTGGAGAAGCTGGAC 2715
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3771 CATTGTCTGCAACTTTGGCAGTGAGCTCAGCCTGGTGTATGTGCCCTCTGTGCTGGAGAAGCTGGAC 3837
