Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11696
• Subject: XM_006716442.1
• Aligned Length: 1941
• Identities: 1877
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGTGCTATGGAACTCCTAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCTATGGAACTCCTAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACC  74

Query   75  AATGCTGCCCATCCACATGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATGCTGCCCATCCACATGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATG  148

Query  149  ATTCTGTGGAGAGGCTGTATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTCTGTGGAGAGGCTGTATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCC  222

Query  223  GACCATGGTTACCATATTGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCATGGTTACCATATTGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGT  296

Query  297  GCCTTTTTTTATTCGTGGTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTTTTTTTATTCGTGGTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGG  370

Query  371  CCCCCACGATCCTGGATATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCCACGATCCTGGATATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTG  444

Query  445  GACCCAGAAAAGCCAGGTAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCCAGAAAAGCCAGGTAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGA  518

Query  519  AAGAGGCAAATTTCTACGTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGAGGCAAATTTCTACGTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATG  592

Query  593  AACGGGTCAAAGAACTATGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACGGGTCAAAGAACTATGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGC  666

Query  667  ATTGAGGATACATCTGGCAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGAGGATACATCTGGCAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAG  740

Query  741  CACGCGGAACCTCTACGCTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACGCGGAACCTCTACGCTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTG  814

Query  815  CCAGCAGAAGCCAAAGAAAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGCAGAAGCCAAAGAAAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTT  888

Query  889  GTCCATACTCGGCAGACACGTTCCTTGCCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGA  962
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCCATACTCGGCAGACACGTTCCTTGTCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGA  962

Query  963  AGAAGAATTGCAAGTGTTGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAAGAATTGCAAGTGTTGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATC  1036

Query 1037  TCCAGGCTTCCAGTGGTGGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCAGGCTTCCAGTGGTGGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACT  1110

Query 1111  GTCCGAGTGACACACAAGTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCGAGTGACACACAAGTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGC  1184

Query 1185  CAGAGCGTGGAAGGACCATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGAGCGTGGAAGGACCATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAA  1258

Query 1259  GAGAAGTGAGAGGACATCTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGAAGTGAGAGGACATCTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAA  1332

Query 1333  GAGAAAGGTGTAAAAAAGCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAAAGGTGTAAAAAAGCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGA  1406

Query 1407  TAGCAAACTGCAACTTTTCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAGCAAACTGCAACTTTTCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGA  1480

Query 1481  AGGGGGAAGAGTGCAGCCTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGGGGAAGAGTGCAGCCTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTC  1554

Query 1555  TGGAACCTGGGATCTTTCTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGAACCTGGGATCTTTCTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGA  1628

Query 1629  GACGCATAATTTTCTTTTCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACGCATAATTTTCTTTTCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATC  1702

Query 1703  AGCTCACAAATACAGTGCACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCTCACAAATACAGTGCACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGA  1776

Query 1777  AGCTGTCAAGGATATAAGCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTTGGAAATAAAGATGGAGGAAGCTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGCTGTCAAGGATATAAGCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTTGGAAATAAAGATGGAGGAAGCTA  1850

Query 1851  TGACCTACACAGAATGTTGCTGTTCCTGGTACCCTGTTCGGCCCCTCTAACCTCCAGAGCTATGGTCTCAGAT-  1923
            |||||||||||||              ||                          |.||.|||||     ||| 
Sbjct 1851  TGACCTACACAGA--------------GG--------------------------ACAGTTATGG-----GATG  1879

Query 1924  --------GCTTCCTTT  1932
                    |.|      
Sbjct 1880  GATGGGAAGGT------  1890