Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11706
• Subject: NM_001311139.1
• Aligned Length: 1263
• Identities: 853
• Gaps: 391

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSGGGGGGGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSGENFEQTPLRRTFKSKVLARYPENVDWNPFDQDAVGML  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CMPKGLAFKTQADPREPQFHAFIITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAEYDVLHAPLADGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  DQSGMEDGEGIPGTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLQQLHQAVTSPQPPPLPLESYIYN  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  VLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQR  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  LMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYLMGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDVDNHFIEL  370

Query    1  ---------------------MAFGIPPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENET  53
                                 ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  PEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGVPPEGNLHCSESASKLKRIRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENET  444

Query   54  IARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDK  127
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  IARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDFKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDK  518

Query  128  ESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNV  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNV  592

Query  202  RTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPASNKWTKR  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  593  RTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAVHPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVLCTGPASNKWTKR  666

Query  276  NAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKR  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  NAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKR  740

Query  350  MLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLS  423
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  741  MLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLS  814

Query  424  TSGILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTK  497
            ||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TSGILLDSERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTK  888

Query  498  KLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  KLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET  962

Query  572  QIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERI  645
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  963  QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERV  1036

Query  646  LVGELLTSQPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLT  719
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  LVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLT  1110

Query  720  LLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNEVVPEENWHTRARNFCRFVTAINNT  793
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1111  LLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEQNDVVPEENWHTRARNFCRFVTAVNNT  1184

Query  794  PRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLV  867
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  PRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLDTSLV  1258

Query  868  KGIDI  872
            |||||
Sbjct 1259  KGIDI  1263