Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11706
• Subject: NM_021494.1
• Aligned Length: 1287
• Identities: 853
• Gaps: 415

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSGGGGGGGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSALCQYIQASKARDGASPFISSTTEGENFEQTPLRRTFK  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  SKVLARYPENVDWNPFDQDAVGMLCMPKGLAFKTQADPREPQFHAFIITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICS  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AMQTLYHMHNAEYDVLHAPLADGGDQSGMEDGEGIPGTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSV  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  LQQLHQAVTSPQPPPLPLESYIYNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVE  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  NVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYLMGLHSNGLDD  370

Query    1  ---------------------------------------------MAFGIPPEGNLHCSESASKLKRLRASELV  29
                                                         ||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  RSKLELPQEANLCFVDVDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGVPPEGNLHCSESASKLKRIRASELV  444

Query   30  SDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIRE  103
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  SDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDFKVQCDEEELRIYQLNIQIRE  518

Query  104  VFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCH  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  VFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCH  592

Query  178  DDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKIGQGKYE  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  DDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAVHPHLLDMKIGQGKYE  666

Query  252  PGFFPKLQSDVLSTGPASNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARTMGSTIRQPKLSNLSP  325
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  667  PGFFPKLQSDVLCTGPASNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSP  740

Query  326  SVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGK  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  SVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGK  814

Query  400  SALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLSTSGILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWV  473
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  SALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDSERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWV  888

Query  474  RLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVP  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  RLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVP  962

Query  548  SKKLGGSMFTANPWICISGELGETQIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVEYVMVRNEIT  621
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  963  SKKLGGSMFTANPWICISGELGETQILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVT  1036

Query  622  GHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERILVGELLTSQPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQE  695
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQE  1110

Query  696  SIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNE  769
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1111  SIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEQND  1184

Query  770  VVPEENWHTRARNFCRFVTAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHT  843
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  VVPEENWHTRARNFCRFVTAVNNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHT  1258

Query  844  LVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI  872
            |||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  LVNSLIRVLQTLQEFNITLDTSLVKGIDI  1287