Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11713
• Subject: NM_001256828.1
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1533
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGACATTCCCTGCAGTGGCTGAGAAGGTCCTCAAGGAGTTCCAGGTGTTACTGCAGCACAGCCCCTCTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACATTCCCTGCAGTGGCTGAGAAGGTCCTCAAGGAGTTCCAGGTGTTACTGCAGCACAGCCCCTCTCC  74

Query   75  CATTGGAAGTACCCGCATGCTGCAGCTTATGACCATCAATATGTTTGCAGTACACAACTCCCAGCTGAAAGACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATTGGAAGTACCCGCATGCTGCAGCTTATGACCATCAATATGTTTGCAGTACACAACTCCCAGCTGAAAGACT  148

Query  149  GCTTCTCGGAGGAGTGCCGCTCTGTGATCCAGGAACAAGCCGCAGCTCTGGGCTTGGCCATGTTTTCTCTACTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTCTCGGAGGAGTGCCGCTCTGTGATCCAGGAACAAGCCGCAGCTCTGGGCTTGGCCATGTTTTCTCTACTG  222

Query  223  GTCCGCCGCTGCACCTGCTTACTTAAGGAGTCCGCCAAAGCTCAGCTGTCCTCTCCTGAGGACCAGGATGACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCGCCGCTGCACCTGCTTACTTAAGGAGTCCGCCAAAGCTCAGCTGTCCTCTCCTGAGGACCAGGATGACCA  296

Query  297  AGACGACATCAAGGTGTCTTCCTTTGTCCCGGACCTGAAGGAGCTGCTCCCCAGTGTCAAAGTCTGGTCAGATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACGACATCAAGGTGTCTTCCTTTGTCCCGGACCTGAAGGAGCTGCTCCCCAGTGTCAAAGTCTGGTCAGATT  370

Query  371  GGATGCTCGGCTACCCGGACACCTGGAATCCTCCTCCCACATCCCTGGATCTGCCCTCGCATGTTGCTGTGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATGCTCGGCTACCCGGACACCTGGAATCCTCCTCCCACATCCCTGGATCTGCCCTCGCATGTTGCTGTGGAT  444

Query  445  GTATGGTCGACGCTGGCTGATTTCTGTAACATACTGACTGCAGTGAATCAGTCTGAGGTGCCACTGTACAAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTATGGTCGACGCTGGCTGATTTCTGTAACATACTGACTGCAGTGAATCAGTCTGAGGTGCCACTGTACAAGGA  518

Query  519  CCCGGATGATGACCTCACCCTTCTTATCCTGGAAGAGGATCGGCTTCTCTCGGGCTTTGTCCCCTTGCTGGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCGGATGATGACCTCACCCTTCTTATCCTGGAAGAGGATCGGCTTCTCTCGGGCTTTGTCCCCTTGCTGGCTG  592

Query  593  CCCCTCAGGACCCCTGCTACGTGGAGAAAACCTCGGATAAGGTTATTGCAGCTGACTGCAAAAGGGTCACAGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCCTCAGGACCCCTGCTACGTGGAGAAAACCTCGGATAAGGTTATTGCAGCTGACTGCAAAAGGGTCACAGTG  666

Query  667  CTGAAGTATTTTCTGGAAGCCCTTTGTGGACAAGAAGAGCCTCTGCTGGCATTCAAGGGTGGAAAGTATGTGTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGAAGTATTTTCTGGAAGCCCTTTGTGGACAAGAAGAGCCTCTGCTGGCATTCAAGGGTGGAAAGTATGTGTC  740

Query  741  AGTGGCACCCGTCCCAGACACCATGGGAAAGGAAATGGGAAGCCAAGAGGGAACACGACTGGAAGATGAGGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGGCACCCGTCCCAGACACCATGGGAAAGGAAATGGGAAGCCAAGAGGGAACACGACTGGAAGATGAGGAGG  814

Query  815  AGGATGTGGTGATTGAAGACTTTGAGGAAGATTCAGAGGCTGAAGGCAGCGGAGGCGAGGATGACATCAGGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGATGTGGTGATTGAAGACTTTGAGGAAGATTCAGAGGCTGAAGGCAGCGGAGGCGAGGATGACATCAGGGAG  888

Query  889  CTTCGGGCCAAGAAGCTGGCTCTGGCCAGGAAGATAGCTGAGCAGCAGCGTCGCCAGGAAAAGATCCAGGCTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCGGGCCAAGAAGCTGGCTCTGGCCAGGAAGATAGCTGAGCAGCAGCGTCGCCAGGAAAAGATCCAGGCTGT  962

Query  963  CCTGGAGGACCACAGTCAGATGAGGCAGATGGAGCTCGAAATCAGACCTTTGTTCCTCGTACCAGACACCAACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGGAGGACCACAGTCAGATGAGGCAGATGGAGCTCGAAATCAGACCTTTGTTCCTCGTACCAGACACCAACG  1036

Query 1037  GCTTCATTGACCACCTGGCCAGTCTGGCGCGGCTGCTGGAGAGCAGGAAGTACATCCTGGTGGTGCCCCTCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTTCATTGACCACCTGGCCAGTCTGGCGCGGCTGCTGGAGAGCAGGAAGTACATCCTGGTGGTGCCCCTCATC  1110

Query 1111  GTGATCAATGAGCTGGACGGCCTGGCCAAGGGGCAGGAGACAGACCACCGGGCTGGGGGCTACGCCCGTGTGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGATCAATGAGCTGGACGGCCTGGCCAAGGGGCAGGAGACAGACCACCGGGCTGGGGGCTACGCCCGTGTGGT  1184

Query 1185  ACAAGAGAAGGCCCGCAAGTCCATCGAGTTCCTCGAGCAGCGATTCGAGAGTCGGGACTCTTGCCTGCGAGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAAGAGAAGGCCCGCAAGTCCATCGAGTTCCTCGAGCAGCGATTCGAGAGTCGGGACTCTTGCCTGCGAGCCC  1258

Query 1259  TGACCAGCCGTGGCAATGAACTCGAATCCATCGCCTTCCGCAGTGAGGACATCACTGGCCAGCTGGGTAACAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGACCAGCCGTGGCAATGAACTCGAATCCATCGCCTTCCGCAGTGAGGACATCACTGGCCAGCTGGGTAACAAC  1332

Query 1333  GATGATCTCATCCTGTCCTGCTGCCTCCACTACTGCAAAGACAAGGCTAAGGACTTCATGCCCGCCAGCAAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATGATCTCATCCTGTCCTGCTGCCTCCACTACTGCAAAGACAAGGCTAAGGACTTCATGCCCGCCAGCAAAGA  1406

Query 1407  GGAGCCAATCCGGCTACTGCGGGAGGTGGTGCTGTTGACGGATGACCGGAACCTGCGTGTGAAGGCGCTCACAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGCCAATCCGGCTACTGCGGGAGGTGGTGCTGTTGACGGATGACCGGAACCTGCGTGTGAAGGCGCTCACAA  1480

Query 1481  GGAATGTTCCTGTACGGGACATCCCAGCCTTCCTCACGTGGGCCCAGGTGGGC  1533
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGAATGTTCCTGTACGGGACATCCCAGCCTTCCTCACGTGGGCCCAGGTGGGC  1533