Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11723
• Subject: XM_011521403.2
• Aligned Length: 2728
• Identities: 2144
• Gaps: 584

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGTGCCAGCAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATGTAGCATCACCTGAAAGCGGCAGTTGCAACAGATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAGTTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTACGGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  TCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTACGGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTC  444

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGGCGTGGTG  11
                                                                           |||||||||||
Sbjct  445  TGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGGGACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTG  518

Query   12  TGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGACTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAG  85
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGACTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAG  592

Query   86  AGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCTTAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAG  159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCTTAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAG  666

Query  160  GATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGGATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACC  233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGGATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACC  740

Query  234  AGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCATTGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAAC  307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCATTGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAAC  814

Query  308  CGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAAGGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTAT  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAAGGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTAT  888

Query  382  GTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATCCCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGA  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATCCCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGA  962

Query  456  CAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGAAATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTC  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGAAATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTC  1036

Query  530  ATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCTTCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCT  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCTTCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCT  1110

Query  604  AAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGCCTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTT  677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGCCTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTT  1184

Query  678  GCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGGGGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACC  751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGGGGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACC  1258

Query  752  TGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGCTGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATG  825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGCTGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATG  1332

Query  826  GAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAGCTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCT  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAGCTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCT  1406

Query  900  CCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCTACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGC  973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCTACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGC  1480

Query  974  ACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGCTTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCT  1047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGCTTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCT  1554

Query 1048  CTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCCAACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCT  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCCAACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCT  1628

Query 1122  GCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGATTTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAG  1195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGATTTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAG  1702

Query 1196  ATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGGAAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTA  1269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGGAAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTA  1776

Query 1270  ATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTATCTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCG  1343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTATCTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCG  1850

Query 1344  GTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGAGAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCC  1417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGAGAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCC  1924

Query 1418  CTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGGAAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATG  1491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGGAAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATG  1998

Query 1492  TTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGCCGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGA  1565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGCCGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGA  2072

Query 1566  ACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACATGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATA  1639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACATGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATA  2146

Query 1640  CAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACTATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCC  1713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACTATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCC  2220

Query 1714  CTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATTCACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAA  1787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATTCACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAA  2294

Query 1788  AGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGAGCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACC  1861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGAGCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACC  2368

Query 1862  TTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATACGCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAG  1935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATACGCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAG  2442

Query 1936  AAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTCCATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACA  2009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTCCATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACA  2516

Query 2010  CCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAAGGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAA--------  2075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 2517  CCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAAGGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGGAGGT  2590

Query 2076  --------------------------------------------------------------CAGTGCATTTGC  2087
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 2591  GCCGCTGCCAGAGAAGTGGTCACTTAGAAGCAGTCCTCACTCCCAAGCCATTTTCTTCCCTGCAGTGCATTTGC  2664

Query 2088  AAGATACCCCAATGGAGTGGTCGTCCATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT  2151
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 2665  AAGATACCCCAATGGAGTGGTCGTCCATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGC-------  2721