Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11723
• Subject: XM_017022037.1
• Aligned Length: 2628
• Identities: 2096
• Gaps: 525

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGGTTGCAACA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCCAAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGTCCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTAC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTAC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  GGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGG  444

Query    1  ------------------------------ATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA  518

Query   45  CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT  592

Query  119  TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG  666

Query  193  ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT  740

Query  267  TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA  814

Query  341  GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC  888

Query  415  CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA  962

Query  489  AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT  1036

Query  563  TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC  1110

Query  637  CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG  1184

Query  711  GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC  1258

Query  785  TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG  1332

Query  859  CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT  1406

Query  933  ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC  1480

Query 1007  TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC  1554

Query 1081  AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT  1628

Query 1155  TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG  1702

Query 1229  AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT  1776

Query 1303  CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA  1850

Query 1377  GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG  1924

Query 1451  AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC  1998

Query 1525  CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA  2072

Query 1599  TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT  1672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT  2146

Query 1673  ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT  2220

Query 1747  CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA  1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA  2294

Query 1821  GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC  1894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC  2368

Query 1895  GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC  1968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC  2442

Query 1969  CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA  2042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA  2516

Query 2043  GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGTGCATTTGCAA-GATACCCCAATGG--AGTGGTCGTCC  2113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|       || ||.|.|   ||||  ..|||..||||
Sbjct 2517  GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGAG-------AAGGAGAAC---ATGGCTGCTGGCTGTCC  2580

Query 2114  ATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT  2151
                                                  
Sbjct 2581  --------------------------------------  2580