Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11745
- Subject:
- XM_006521570.2
- Aligned Length:
- 1379
- Identities:
- 999
- Gaps:
- 310
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC 148
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA-- 15
|||||.....||.||
Sbjct 149 GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG 222
Query 16 -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT 88
|||| .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 223 GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT 292
Query 89 TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC 162
|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 293 TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC 366
Query 163 GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC 235
.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct 367 AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC 439
Query 236 AAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT 309
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 AGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT 513
Query 310 TCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCG 383
|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 514 TCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCG 587
Query 384 GCAGATGTTTGG------------------------------------------------------GGGATTCG 403
|||||||||||| ||||||||
Sbjct 588 GCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCG 661
Query 404 GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGC 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 662 GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGC 735
Query 478 CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGG 551
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 736 CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGG 809
Query 552 TTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATG 625
.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 810 CTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATG 883
Query 626 TGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCATT 699
||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 884 TGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCATT 957
Query 700 CCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCG 773
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 958 CCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCG 1031
Query 774 GACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACG 847
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACG 1105
Query 848 GATTTTACGGTGCTGACCTCTAT--------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACA 889
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1106 GATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAATCTGCAAACTGCTTCAGATCAAACAGGGTGGATATGCAGCCTACA 1179
Query 890 GATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTAT 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1180 GATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTAC 1253
Query 964 GGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAG 1037
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 GGCAGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAG 1327
Query 1038 TTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC---------- 1074
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 TTTGTACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG 1374