Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11745
• Subject: XM_006521579.3
• Aligned Length: 1358
• Identities: 939
• Gaps: 319

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGGAGA  7
                                                                               |||||..
Sbjct    1  ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGCGAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATT  74

Query    8  AAAAGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  78
            ...||.||   ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  144

Query   79  ACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGC  152
            ||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  145  ACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGC  218

Query  153  CGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCA  225
            ||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  219  CGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCA  291

Query  226  CCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAG  299
            |||||||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  292  CCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAG  365

Query  300  TAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACC  373
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  366  TAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACC  439

Query  374  CTGACCTCCGGCAGATGTTTGG----------------------------------------------------  395
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  440  CTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCC  513

Query  396  --GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGT  467
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  514  AAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGT  587

Query  468  GGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCAT  541
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  588  GGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCAT  661

Query  542  ATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTT  615
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  ATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTT  735

Query  616  CAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCC  689
            |||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  736  CAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCC  809

Query  690  TTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAG  751
            |.||||||            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct  810  TCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAG  883

Query  752  CCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTAT  825
            |||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  CCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTAT  957

Query  826  CCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------CAGCC  885
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||         ||..|
Sbjct  958  CCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTC  1031

Query  886  TA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC--------------AA  913
            ||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||              ||
Sbjct 1032  TAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA  1103

Query  914  CCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGC-----TTAC------------------AG  953
               ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||                  ||
Sbjct 1104  ---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAG  1163

Query  954  TGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCC  1004
            .|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|.|.|||...|
Sbjct 1164  GGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGC  1237

Query 1005  TGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG-----------CC  1060
            ||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||           ||
Sbjct 1238  TGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACC  1300

Query 1061  GATTTGCCCCCTAC------------  1074
            |.|.|   |||.|.            
Sbjct 1301  GCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1323