Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11745
• Subject: XM_006521586.3
• Aligned Length: 1279
• Identities: 950
• Gaps: 236

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT  148

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA  221
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  149  ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA  221

Query  222  CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGA  292
            .||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  222  TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGA  295

Query  293  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  296  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTC  369

Query  367  CGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG---------------------------------------------  395
            ||.||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  370  CGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCG  443

Query  396  ---------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG  460
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  444  CGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACG  517

Query  461  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTC  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  518  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTC  591

Query  535  ACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATC  608
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  592  ACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATC  665

Query  609  CAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTT  682
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  666  CAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTT  739

Query  683  ACATTCCTTTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCAT  756
            ||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  740  ACATCCCTCTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCAT  813

Query  757  TTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG  830
            .||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG  887

Query  831  TGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA---  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||         ||..|||   
Sbjct  888  TGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAAT  961

Query  888  ---------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA  918
                                       |.||||| .|||| .|  |.||||||              ||   ||
Sbjct  962  CTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CA  1030

Query  919  -----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGC-----TTAC------------------AGTGAC-  957
                       ||||..|||       |.|.||    .||     ||||                  ||.||| 
Sbjct 1031  TTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACC  1093

Query  958  ---GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-C  1008
               .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|.|.|||...|||| |
Sbjct 1094  AGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCAC  1167

Query 1009  GCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTT  1065
            |||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||           |||.|.|
Sbjct 1168  GCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT  1230

Query 1066  GCCCCCTAC------------  1074
               |||.|.            
Sbjct 1231  ---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1248