Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11745
• Subject: XM_006521599.2
• Aligned Length: 1359
• Identities: 959
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC  148

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA--  15
                                                                     |||||.....||.||  
Sbjct  149  GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG  222

Query   16  -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT  88
             ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  223  GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT  292

Query   89  TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC  162
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  293  TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC  366

Query  163  GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC  235
            .||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct  367  AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC  439

Query  236  AAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  309
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  513

Query  310  TCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCG  383
            |||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  514  TCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCG  587

Query  384  GCAGATGTTTGG------------------------------------------------------GGGATTCG  403
            ||||||||||||                                                      ||||||||
Sbjct  588  GCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCG  661

Query  404  GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGC  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGC  735

Query  478  CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGG  551
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  736  CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGG  809

Query  552  TTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATG  625
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  810  CTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATG  883

Query  626  TGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA--  697
            ||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||  
Sbjct  884  TGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGT  957

Query  698  ----------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAG  761
                      |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  958  CTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAG  1031

Query  762  GGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGG  835
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 1032  GGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG-----  1100

Query  836  TTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACT  909
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  -----------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACT  1139

Query  910  GCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGA  983
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1140  GCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTGA  1213

Query  984  CCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACA  1057
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1214  CCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTACA  1287

Query 1058  GCCGATTTGCCCCCTAC----------  1074
            |||||||||||||||||          
Sbjct 1288  GCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG  1314