Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11745
• Subject: XM_017028690.1
• Aligned Length: 1204
• Identities: 1062
• Gaps: 131

Alignment

Query    1  ------------------ATGGA-GAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG  55
                              ||||| .|..||.|...||.|..| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATGGTGTATATTGTATGGATTATCAATATCCTGTTGTC-CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG  73

Query   56  ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG  147

Query  130  GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA  221

Query  204  CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAG  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAG  295

Query  275  ACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCT  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  ACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCT  369

Query  349  AATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG---------------------------  395
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  370  AATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGA  443

Query  396  ---------------------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGG  442
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  AATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGG  517

Query  443  CCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATG  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  CCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATG  591

Query  517  ACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCC  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  ACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCC  665

Query  591  GGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAA  739

Query  665  GAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCC  726
            |||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  GAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCC  813

Query  727  ACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGT  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGT  887

Query  801  ACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT----  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  888  ACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAG  961

Query  871  ----------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCG  916
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AATCTGCAAACTGCTTCAGATCAAACAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCG  1035

Query  917  CAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTAC  990
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTAC  1109

Query  991  CATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATT  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATT  1183

Query 1065  TGCCCCCTAC----------  1074
            ||||||||||          
Sbjct 1184  TGCCCCCTACTGAAGTGACG  1203