Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11749
Subject:
NM_012455.3
Aligned Length:
1056
Identities:
1025
Gaps:
29

Alignment

Query    1  MMGDYRLPDHPQPMEILNLYLGDSLEPHPGECPRETCSHEDPPEPFEEQTWATDPPEPTRQNVPPWGSGVELTH  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MMGDYRLPDHPQPMEILNLYLGDSLEPHPGECPRETCSHEDPPEPFEEQTWATDPPEPTRQNVPPWGSGVELTH  74

Query   75  LGSWVHQDGLEPCQEQTRATDPPESTRQDAPPWGSGVELTHLGSPSAQRDHRQNTASPGSPVNSHLPGSPKQNR  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LGSWVHQDGLEPCQEQTRATDPPESTRQDAPPWGSGVELTHLGSPSAQREHRQNTASPGSPVNSHLPGSPKQNR  148

Query  149  STSTQVVFWAGILQAQMCVLDLEEELEKTEGLKAGLKCCLPTPPVDLPGDTGLHSSPPENEDSGEDSSEPEGEG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  STSTQVVFWAGILQAQMCVLDLEEELEKTEGLKAGLKCCLPTPPVDLPGDTGLHSSPPENEDSGEDSSEPEGEG  222

Query  223  QAWLREGTPDSSPQWGAEEESMFFSNPLFLASPCSENSASGECFSWAASDSHAGVRTGPESPATLEPPLPEDTV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  QAWLREGTPDSSPQWGAEEESMFFSNPLFLASPCSENSASGECFSWGASDSHAGVRTGPESPATLEPPLPEDTV  296

Query  297  LWELESEPDLGDGAAISGHCTPPFPVPIYKPHSICWASVAAAEGAPAAPPGHGESEGDRLGPAPSAAPCVDEAL  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  LWELESEPDLGDGAAISGHCTPPFPVPIYKPHSICWASVAAAEGAPAAPPGHGESEGDRLGPAPSAAPCVDEAL  370

Query  371  TWESGCVGSDLGPAAHPVQPWASLSPEGWQRGGPFWPQVTLNSQDR----------------------------  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  371  TWESGCVGSDLGPAAHPVQPWASLSPEGWQRGGPFWPQVTLNSQDRDEREGGHPQESLPCTLAPCPWRSPASSP  444

Query  417  EPSSPESESRGPGPRPSPASSQEGSPQLQHHSSGILPKWTLDASQSSLLETDGEQPSSLKKKEAGEAPKPGEEV  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  EPSSPESESRGPGPRPSPASSQEGSPQLQHHSSGILPKWTLDASQSSLLETDGEQPSSLKKKEAGEAPKPGEEV  518

Query  491  KSEGTARPAETGDVQPDIHLTSAEHENLRTPMNSSWLPGSPMPQAQSPEEGQRPPAGDKLANGVRNNKVAWNLA  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  KSEGTARPAETGDVQPDIHLTSAEHENLRTPMNSSWLPGSPMPQAQSPEEGQRPPAGDKLANGVRNNKVAWNLA  592

Query  565  SRLYRLEGFRKSEVAAYLQKNNDFSRAVAEEYLSFFQFGGQSLDRALRSFLQALVLSGETQERERILYQFSRRF  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  SRLYRLEGFRKSEVAAYLQKNNDFSRAVAEEYLSFFQFGGQSLDRALRSFLQALVLSGETQERERILYQFSRRF  666

Query  639  HHCNPGIFPSVDSVHTLTCAIMLLNTDLHGQNIGKSMSCQEFITNLNGLRDGGNFPKELLKALYWSIRSEKLEW  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  HHCNPGIFPSVDSVHTLTCAIMLLNTDLHGQNIGKSMSCQEFITNLNGLRDGGNFPKELLKALYWSIRSEKLEW  740

Query  713  AVDEEDTARPEKAQPSLPAGKMSKPFLQLAQDPTVPTYKQGILARKMHQDADGKKTPWGKRGWKMFHTLLRGMV  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AVDEEDTARPEKAQPSLPAGKMSKPFLQLAQDPTVPTYKQGILARKMHQDADGKKTPWGKRGWKMFHTLLRGMV  814

Query  787  LYFLK-GEDHCLEGESLVGQMVDEPVGVHHSLATPATHYTKKPHVFQLRTADWRLYLFQAPTAKEMSSWIARIN  859
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  LYFLKQGEDHCLEGESLVGQMVDEPVGVHHSLATPATHYTKKPHVFQLRTADWRLYLFQAPTAKEMSSWIARIN  888

Query  860  LAAATHSAPPFPAAVGSQRRFVRPILPVGPAQSSLEEQHRSHENCLDAAADDLLDLQRNLPERRGRGRELEEHR  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LAAATHSAPPFPAAVGSQRRFVRPILPVGPAQSSLEEQHRSHENCLDAAADDLLDLQRNLPERRGRGRELEEHR  962

Query  934  LRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPSDALDLWEEQLGREAGGTREPKLSLKKSHSSPSLHQDEAPTTAKVKR  1007
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Sbjct  963  LRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPSDALDLWEEQLGREAGGTREPKLSLKKSHSSPSLHQDEAPTTAKVKR  1036

Query 1008  NISERRTYRKIIPKRNRNQL  1027
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Sbjct 1037  NISERRTYRKIIPKRNRNQL  1056