Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11749
- Subject:
- XM_006712394.2
- Aligned Length:
- 3165
- Identities:
- 2805
- Gaps:
- 357
Alignment
Query 1 ATGATGGGTGACTACAGACTCCCTGACCACCCCCAGCCCATGGAAATTCTCAACCTGTACTTGGGAGACAGCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGGGTGACTACAGACTCCCTGACCACCCCCAGCCCATGGAAATTCTCAACCTGTACTTGGGAGACAGCCT 74
Query 75 GGAGCCCCACCCAGGAGAGTGCCCAAGGGAAACGTGCAGCCATGAGGATCCACCGGAGCCTTTCGAGGAGCAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGCCCCACCCAGGAGAGTGCCCAAGGGAAACGTGCAGCCATGAGGATCCACCGGAGCCTTTCGAGGAGCAAA 148
Query 149 CCTGGGCCACTGACCCTCCTGAACCTACCAGACAAAATGTTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTGGGCCACTGACCCTCCTGAACCTACCAGACAAAATGTTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACAC 222
Query 223 CTGGGGAGCTGGGTCCATCAGGACGGGCTGGAGCCTTGCCAGGAGCAAACCCGGGCCACTGACCCTCCTGAATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGGGAGCTGGGTCCATCAGGACGGGCTGGAGCCTTGCCAGGAGCAAACCCGGGCCACTGACCCTCCTGAATC 296
Query 297 TACCAGACAAGATGCTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACACCTGGGGAGCCCCTCTGCCCAGAGGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TACCAGACAAGATGCTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACACCTGGGGAGCCCCTCTGCCCAGAGGG 370
Query 371 ATCACAGGCAGAACACAGCATCACCAGGGTCACCAGTGAACAGCCATCTACCGGGGAGCCCAAAGCAGAACCGG 444
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCACAGGCAGAACACAGCATCACCAGGGTCACCAGTGAACAGCCATCTACCGGGGAGCCCAAAGCAGAACCGG 444
Query 445 AGCACGTCCACACAGGTAGTGTTCTGGGCAGGCATCCTGCAGGCCCAGATGTGTGTCCTAGACCTGGAGGAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCACGTCCACACAGGTAGTGTTCTGGGCAGGCATCCTGCAGGCCCAGATGTGTGTCCTAGACCTGGAGGAGGA 518
Query 519 GCTGGAGAAGACGGAAGGGCTCAAGGCTGGGCTGAAATGCTGTCTCCCCACGCCCCCTGTGGACCTCCCCGGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGAGAAGACGGAAGGGCTCAAGGCTGGGCTGAAATGCTGTCTCCCCACGCCCCCTGTGGACCTCCCCGGGG 592
Query 593 ACACGGGCCTGCACTCCAGCCCACCTGAGAATGAAGACTCAGGGGAAGACAGCAGCGAGCCTGAGGGAGAGGGC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACACGGGCCTGCACTCCAGCCCACCTGAGAATGAAGACTCAGGGGAAGACAGCAGTGAGCCTGAGGGAGAGGGC 666
Query 667 CAGGCATGGCTGAGAGAGGGAACCCCAGACTCTTCCCCACAGTGGGGAGCTGAGGAGGAGAGCATGTTCTTCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGCATGGCTGAGAGAGGGAACCCCAGACTCTTCCCCACAGTGGGGAGCTGAGGAGGAGAGCATGTTCTTCAG 740
Query 741 CAACCCCCTCTTCCTGGCGAGTCCTTGCTCAGAGAACAGTGCTTCTGGAGAGTGCTTTTCCTGGGCGGCTTCAG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 741 CAACCCCCTCTTCCTGGCGAGTCCTTGCTCAGAGAACAGTGCTTCTGGAGAGTGCTTTTCCTGGGGGGCTTCAG 814
Query 815 ACTCCCATGCAGGTGTGAGGACTGGACCTGAGAGCCCAGCGACTCTGGAGCCTCCCCTCCCAGAAGACACAGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTCCCATGCAGGTGTGAGGACTGGACCTGAGAGCCCAGCGACTCTGGAGCCTCCCCTCCCAGAAGACACAGTG 888
Query 889 CTGTGGGAGCTGGAAAGTGAGCCAGATTTGGGGGACGGCGCTGCTATCAGTGGGCATTGTACCCCTCCATTCCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTGGGAGCTGGAAAGTGAGCCAGATTTGGGGGACGGCGCTGCTATCAGTGGGCATTGTACCCCTCCATTCCC 962
Query 963 TGTGCCCATCTATAAACCACACTCCATCTGCTGGGCCTCAGTGGCTGCCGCTGAGGGGGCTCCTGCAGCACCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTGCCCATCTATAAACCACACTCCATCTGCTGGGCCTCAGTGGCTGCCGCTGAGGGGGCTCCTGCAGCACCTC 1036
Query 1037 CTGGTCACGGGGAGAGTGAGGGAGATAGGCTTGGTCCTGCTCCATCTGCAGCACCGTGTGTGGACGAAGCATTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGGTCACGGGGAGAGTGAGGGAGATAGGCTTGGTCCTGCTCCATCTGCAGCACCGTGTGTGGACGAAGCATTG 1110
Query 1111 ACCTGGGAATCAGGATGTGTCGGATCTGATCTTGGCCCTGCTGCACATCCTGTGCAACCTTGGGCCTCTCTCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCTGGGAATCAGGATGTGTCGGATCTGATCTTGGCCCTGCTGCACATCCTGTGCAACCTTGGGCCTCTCTCAG 1184
Query 1185 CCCTGAGGGCTGGCAGAGAGGAGGTCCTTTTTGGCCCCAGGTGACTCTTAACTCCCAGGACAG----------- 1247
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCTGAGGGCTGGCAGAGAGGAGGTCCTTTTTGGCCCCAGGTGACTCTTAACTCCCAGGACAGAGATGAGAGGG 1258
Query 1248 -------------------------------------------------------------------------A 1248
|
Sbjct 1259 AGGGTGGACACCCCCAGGAATCTCTTCCCTGCACCTTGGCCCCCTGCCCCTGGAGGAGCCCAGCTTCTTCTCCA 1332
Query 1249 GAGCCTAGCAGCCCAGAATCTGAGAGCAGAGGCCCTGGTCCCAGGCCCAGCCCTGCATCGTCCCAGGAGGGCAG 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGCCTAGCAGCCCAGAATCTGAGAGCAGAGGCCCTGGTCCCAGGCCCAGCCCTGCATCGTCCCAGGAGGGCAG 1406
Query 1323 CCCGCAGCTTCAACACCACAGCTCAGGCATTTTGCCCAAGTGGACACTAGATGCTTCACAGTCTTCACTCTTGG 1396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCCGCAGCTTCAACACCACAGCTCAGGCATTTTGCCCAAGTGGACACTAGATGCTTCACAGTCTTCACTCTTGG 1480
Query 1397 AGACGGATGGGGAACAGCCAAGTTCCTTGAAGAAAAAGGAGGCAGGGGAGGCCCCAAAACCAGGCGAGGAAGTA 1470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGACGGATGGGGAACAGCCAAGTTCCTTGAAGAAAAAGGAGGCAGGGGAGGCCCCAAAACCAGGCGAGGAAGTA 1554
Query 1471 AAGAGTGAAGGAACAGCCAGGCCTGCAGAGACTGGAGACGTCCAGCCTGACATTCACCTGACTTCTGCAGAACA 1544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAGAGTGAAGGAACAGCCAGGCCTGCAGAGACTGGAGACGTCCAGCCTGACATTCACCTGACTTCTGCAGAACA 1628
Query 1545 TGAGAATCTGAGGACACCGATGAACTCTTCTTGGCTTCCTGGGAGCCCTATGCCCCAAGCACAGTCCCCAGAGG 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGAGAATCTGAGGACACCGATGAACTCTTCTTGGCTTCCTGGGAGCCCTATGCCCCAAGCACAGTCCCCAGAGG 1702
Query 1619 AAGGCCAGAGACCACCAGCTGGAGACAAGCTAGCTAATGGCGTCAGGAACAACAAGGTAGCCTGGAACTTGGCC 1692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGGCCAGAGACCACCAGCTGGAGACAAGCTAGCTAATGGCGTCAGGAACAACAAGGTAGCCTGGAACTTGGCC 1776
Query 1693 TCACGCCTCTATCGCCTGGAGGGCTTCCGGAAGTCTGAAGTGGCTGCCTACCTGCAGAAGAACAATGACTTTAG 1766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCACGCCTCTATCGCCTGGAGGGCTTCCGGAAGTCTGAAGTGGCTGCCTACCTGCAGAAGAACAATGACTTTAG 1850
Query 1767 CAGGGCTGTGGCTGAGGAGTACCTGTCCTTCTTCCAGTTTGGAGGCCAGAGTCTGGACCGAGCCCTCCGGAGCT 1840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGGGCTGTGGCTGAGGAGTACCTGTCCTTCTTCCAGTTTGGAGGCCAGAGTCTGGACCGAGCCCTCCGGAGCT 1924
Query 1841 TCCTCCAGGCCTTGGTGCTCAGTGGGGAGACTCAGGAACGGGAGCGAATCCTCTACCAGTTCTCCAGACGCTTC 1914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TCCTCCAGGCCTTGGTGCTCAGTGGGGAGACTCAGGAACGGGAGCGAATCCTCTACCAGTTCTCCAGACGCTTC 1998
Query 1915 CACCATTGCAATCCGGGGATCTTCCCCTCAGTAGATTCTGTACACACCTTGACATGTGCAATCATGCTGCTTAA 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CACCATTGCAATCCGGGGATCTTCCCCTCAGTAGATTCTGTACACACCTTGACATGTGCAATCATGCTGCTTAA 2072
Query 1989 CACGGACCTGCATGGACAGAACATTGGGAAGAGCATGAGCTGCCAGGAATTCATAACCAACCTGAATGGGCTGA 2062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CACGGACCTGCATGGACAGAACATTGGGAAGAGCATGAGCTGCCAGGAATTCATAACCAACCTGAATGGGCTGA 2146
Query 2063 GGGATGGCGGGAACTTCCCCAAGGAGCTGCTGAAGGCCCTCTACTGGTCTATCCGCAGCGAGAAGCTCGAGTGG 2136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GGGATGGCGGGAACTTCCCCAAGGAGCTGCTGAAGGCCCTCTACTGGTCTATCCGCAGCGAGAAGCTCGAGTGG 2220
Query 2137 GCCGTGGATGAAGAAGACACAGCCAGACCTGAGAAGGCCCAGCCGTCCCTGCCAGCTGGCAAGATGAGCAAGCC 2210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCCGTGGATGAAGAAGACACAGCCAGACCTGAGAAGGCCCAGCCGTCCCTGCCAGCTGGCAAGATGAGCAAGCC 2294
Query 2211 CTTCCTTCAGCTGGCTCAGGATCCCACAGTGCCCACCTACAAGCAGGGCATCCTGGCTCGGAAAATGCATCAAG 2284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTTCCTTCAGCTGGCTCAGGATCCCACAGTGCCCACCTACAAGCAGGGCATCCTGGCTCGGAAAATGCATCAAG 2368
Query 2285 ATGCAGACGGCAAGAAGACGCCATGGGGCAAGCGTGGCTGGAAGATGTTCCACACCTTACTGCGAGGGATGGTT 2358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ATGCAGACGGCAAGAAGACGCCATGGGGCAAGCGTGGCTGGAAGATGTTCCACACCTTACTGCGAGGGATGGTT 2442
Query 2359 CTCTACTTCCTGAAGGGAGAAGACCACTGTCTGGAGGGGGAGAGCTTGGTGGGGCAGATGGTGGATGAGCCCGT 2432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CTCTACTTCCTGAAGGGAGAAGACCACTGTCTGGAGGGGGAGAGCTTGGTGGGGCAGATGGTGGATGAGCCCGT 2516
Query 2433 GGGGGTGCACCACTCGCTGGCCACCCCCGCCACGCATTACACCAAGAAGCCGCACGTCTTCCAGCTGCGCACGG 2506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GGGGGTGCACCACTCGCTGGCCACCCCCGCCACGCATTACACCAAGAAGCCGCACGTCTTCCAGCTGCGCACGG 2590
Query 2507 CTGACTGGCGCCTCTACCTCTTCCAGGCACCCACTGCCAAGGAGATGAGCTCCTGGATCGCGCGCATCAACTTG 2580
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTGACTGGCGCCTCTACCTCTTCCAGGCACC------------------------------------------- 2621
Query 2581 GCTGCGGCCACCCACTCCGCGCCGCCCTTCCCCGCCGCTGTGGGCTCCCAGCGCAGATTCGTGCGGCCCATCCT 2654
Sbjct 2622 -------------------------------------------------------------------------- 2621
Query 2655 GCCCGTGGGCCCCGCCCAGAGCTCCCTGGAGGAGCAGCATCGATCCCACGAGAACTGCCTGGACGCTGCCGCGG 2728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622 ----------------------------GAGGAGCAGCATCGATCCCACGAGAACTGCCTGGACGCTGCCGCGG 2667
Query 2729 ACGACCTGCTGGATCTACAGAGGAACCTGCCGGAGCGGCGGGGCCGTGGCCGCGAGCTGGAGGAGCACCGCCTG 2802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2668 ACGACCTGCTGGATCTACAGAGGAACCTGCCGGAGCGGCGGGGCCGTGGCCGCGAGCTGGAGGAGCACCGCCTG 2741
Query 2803 CGGAAGGAGTACCTGGAGTACGAGAAAACCCGCTACGAGACCTACGTGCAGCTGCTGGTGGCCCGCCTGCACTG 2876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 CGGAAGGAGTACCTGGAGTACGAGAAAACCCGCTACGAGACCTACGTGCAGCTGCTGGTGGCCCGCCTGCACTG 2815
Query 2877 CCCCTCTGATGCTCTGGACCTGTGGGAGGAGCAGCTGGGGAGGGAAGCTGGAGGCACTCGGGAGCCCAAGCTCA 2950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2816 CCCCTCTGATGCTCTGGACCTGTGGGAGGAGCAGCTGGGGAGGGAAGCTGGAGGCACTCGGGAGCCCAAGCTCA 2889
Query 2951 GCCTGAAGAAGTCCCACTCGAGCCCGTCCCTGCACCAGGATGAGGCTCCCACCACGGCCAAGGTGAAGCGCAAC 3024
|||
Sbjct 2890 GCC----------------------------------------------------------------------- 2892
Query 3025 ATCTCAGAGCGCAGAACCTACCGGAAGATCATCCCTAAGCGGAACCGCAATCAGCTG 3081
Sbjct 2893 --------------------------------------------------------- 2892