Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11784
• Subject: XM_011544901.1
• Aligned Length: 2145
• Identities: 1984
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCGCAGAGTCTGGAAAGAGATTCAAACCCAGCAAGTATGTCCCGGTCTCTGCAGCCGCCATCTTCCTAGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGAGCTACGACACTCTTCTTTGCCTTTACGTGTCCAGGACTAAGCCTGTATGTGTCACCTGCAGTGCCCATCT  148

Query    1  -----------ATGTTTCTCTTTGTGTTGGCCAACTTCAGCATGGCCACCTTCATGGACCCAGGGATTTTCCCT  63
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAATGCAATTATGTTTCTCTTTGTGTTGGCCAACTTCAGCATGGCCACCTTCATGGACCCAGGGATTTTCCCT  222

Query   64  CGAGCTGAGGAGGATGAGGACAAGGAAGATGATTTCCGAGCTCCCCTTTACAAAACAGTGGAGATAAAGGGCAT  137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAGCTGAGGAGGATGAGGACAAGGAAGATGATTTCCGAGCTCCCCTTTACAAAACAGTGGAGATAAAGGGCAT  296

Query  138  CCAGGTGCGCATGAAATGGTGTGCCACCTGCCGCTTTTACCGTCCCCCTCGATGTTCCCACTGCAGTGTCTGTG  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGTGCGCATGAAATGGTGTGCCACCTGCCGCTTTTACCGTCCCCCTCGATGTTCCCACTGCAGTGTCTGTG  370

Query  212  ACAACTGTGTGGAGGAATTTGATCATCACTGCCCCTGGGTGAATAACTGTATTGGTCGCCGGAACTACCGTTAT  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAACTGTGTGGAGGAATTTGATCATCACTGCCCCTGGGTGAATAACTGTATTGGTCGCCGGAACTACCGTTAT  444

Query  286  TTTTTCCTTTTCCTCCTTTCCCTGACAGCCCACATTATGGGTGTGTTTGGCTTTGGCCTCCTTTATGTCCTCTA  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTTTCCTTTTCCTCCTTTCCCTGACAGCCCACATTATGGGTGTGTTTGGCTTTGGCCTCCTTTATGTCCTCTA  518

Query  360  CCACATAGAGGAACTCTCAGGGGTCCGCACGGCTGTCACAATGGCAGTAATGTGTGTGGCTGGCTTATTCTTCA  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACATAGAGGAACTCTCAGGGGTCCGCACGGCTGTCACAATGGCAGTAATGTGTGTGGCTGGCTTATTCTTCA  592

Query  434  TCCCTGTAGCTGGCCTCACGGGATTTCACGTGGTTCTGGTGGCCAGGGGACGCACAACCAATGAACAGGTTACG  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCTGTAGCTGGCCTCACGGGATTTCACGTGGTTCTGGTGGCCAGGGGACGCACAACCAATGAACAGGTTACG  666

Query  508  GGTAAATTCCGGGGAGGTGTGAACCCCTTCACCAATGGCTGCTGTAACAATGTCAGCCGTGTTCTCTGCAGTTC  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTAAATTCCGGGGAGGTGTGAACCCCTTCACCAATGGCTGCTGTAACAATGTCAGCCGTGTTCTCTGCAGTTC  740

Query  582  TCCAGCACCCAGGTATTTGGGGAGACCAAAGAAAGAGAAGACAATTGTAATCAGACCTCCCTTCCTTCGACCAG  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCAGCACCCAGGTATTTGGGGAGACCAAAGAAAGAGAAGACAATTGTAATCAGACCTCCCTTCCTTCGACCAG  814

Query  656  AAGTTTCAGATGGGCAGATAACTGTGAAGATCATGGATAATGGCATCCAGGGAGAGCTGAGGAGAACAAAGTCT  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTTTCAGATGGGCAGATAACTGTGAAGATCATGGATAATGGCATCCAGGGAGAGCTGAGGAGAACAAAGTCT  888

Query  730  AAGGGAAGCCTGGAGATAACAGAGAGCCAGTCTGCAGATGCTGAACCTCCACCTCCTCCTAAGCCAGACCTGAG  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGGAAGCCTGGAGATAACAGAGAGCCAGTCTGCAGATGCTGAACCTCCACCTCCTCCTAAGCCAGACCTGAG  962

Query  804  CCGTTACACAGGGTTGCGAACACACCTCGGCCTGGCTACTAATGAGGATAGTAGCTTATTGGCCAAGGACAGCC  877
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGTTACACAGGGTTGCGAACACACCTCGGCTTGGCTACTAATGAGGATAGTAGCTTATTGGCCAAGGACAGCC  1036

Query  878  CCCCGACACCTACCATGTACAAGTATCGGCCGGGTTACAGTAGCAGCAGTACGTCAGCTGCCATGCCGCATTCC  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCCGACACCTACCATGTACAAGTATCGGCCGGGTTACAGTAGCAGCAGTACGTCAGCTGCCATGCCGCATTCC  1110

Query  952  TCCAGCGCCAAGTTGAGTCGTGGGGACAGCTTGAAGGAGCCAACCTCAATTGCAGAGAGCAGCCGTCACCCCAG  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCAGCGCCAAGTTGAGTCGTGGGGACAGCTTGAAGGAGCCAACCTCAATTGCAGAGAGCAGCCGTCACCCCAG  1184

Query 1026  CTACCGCTCAGAGCCCAGCTTGGAACCAGAGAGCTTCCGTTCTCCTACCTTTGGCAAAAGTTTTCACTTCGATC  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACCGCTCAGAGCCCAGCTTGGAACCAGAGAGCTTCCGTTCTCCTACCTTTGGCAAAAGTTTTCACTTCGATC  1258

Query 1100  CACTATCCAGTGGCTCACGCTCCTCCAGCCTCAAGTCAGCCCAGGGCACAGGCTTTGAGCTGGGCCAGTTGCAA  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CACTATCCAGTGGCTCACGCTCCTCCAGCCTCAAGTCAGCCCAGGGCACAGGCTTTGAGCTGGGCCAGTTGCAA  1332

Query 1174  TCCATTCGTTCAGAGGGCACCACCTCCACCTCCTATAAGAGCCTGGCCAACCAGACACGCAATGGAAGCCTATC  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCATTCGTTCAGAGGGCACCACCTCCACCTCCTATAAGAGCCTGGCCAACCAGACACGCAATGGAAGCCTATC  1406

Query 1248  TTATGACAGCTTGCTCACACCTTCAGACAGCCCTGATTTTGAGTCAGTGCAGGCAGGGCCTGAGCCAGACCCAC  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTATGACAGCTTGCTCACACCTTCAGACAGCCCTGATTTTGAGTCAGTGCAGGCAGGGCCTGAGCCAGACCCAC  1480

Query 1322  CTTTAGGCTATACCTCTCCTTTCCTGTCAGCCAGGCTGGCCCAGCAACGGGAAGCTGAGAGGCACCCACGTTTG  1395
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTTTAGGCTATACCTCTCCCTTCCTGTCAGCCAGGCTGGCCCAGCAACGGGAAGCTGAGAGGCACCCACGTTTG  1554

Query 1396  GTGCCAACTGGCCCAACACACCGAGAGCCCTCACCAGTCCGTTACGACAATCTGTCGCGCCACATTGTGGCCTC  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGCCAACTGGCCCAACACACCGAGAGCCCTCACCAGTCCGTTACGACAATCTGTCGCGCCACATTGTGGCCTC  1628

Query 1470  TCTCCAGGAACGAGAGAAGTTGCTGCGCCAGTCACCCCCACTCCCGGGCCGTGAGGAAGAACCAGGCTTGGGGG  1543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTCCAGGAACGAGAGAAGTTGCTGCGCCAGTCACCCCCACTCCCGGGCCGTGAGGAAGAACCAGGCTTGGGGG  1702

Query 1544  ACTCAGGCATTCAGTCAACACCAGGCTCGGGCCATGCCCCTCGTACTAGTTCCTCCTCAGATGATTCAAAGAGA  1617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACTCAGGCATTCAGTCAACACCAGGCTCGGGCCATGCCCCTCGTACTAGTTCCTCCTCAGATGATTCAAAGAGA  1776

Query 1618  TCACCTTTGGGCAAGACTCCACTGGGACGCCCAGCTGTCCCCCGTTTTGGCAAGCCAGATGGGCTAAGGGGCCG  1691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCACCTTTGGGCAAGACTCCACTGGGACGCCCAGCTGTCCCCCGTTTTGGCAAGCCAGATGGGCTAAGGGGCCG  1850

Query 1692  GGGAGTAGGGTCCCCTGAACCAGGCCCAACAGCCCCATACCTGGGCCGATCGATGTCTTACAGCAGCCAAAAAG  1765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGGAGTAGGGTCCCCTGAACCAGGCCCAACAGCCCCATACCTGGGCCGATCGATGTCTTACAGCAGCCAAAAAG  1924

Query 1766  CCCAACCTGGTGTCTCTGAGACAGAAGAAGTGGCCTTGCAGCCATTACTGACACCCAAAGATGAAGTACAGCTG  1839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCAACCTGGTGTCTCTGAGACAGAAGAAGTGGCCTTGCAGCCATTACTGACACCCAAAGATGAAGTACAGCTG  1998

Query 1840  AAGACCACCTACAGCAAATCCAACGGGCAGCCCAAGAGCTTAGGCTCAGCCTCCCCTGGCCCAGGCCAGCCACC  1913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGACCACCTACAGCAAATCCAACGGGCAGCCCAAGAGCTTAGGCTCAGCCTCCCCTGGCCCAGGCCAGCCACC  2072

Query 1914  TCTCAGTAGCCCCACGAGGGGAGGAGTCAAGAAGGTGTCAGGGGTTGGTGGTACCACCTATGAGATTTCGGTG  1986
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCTCAGTAGCCCCACGAGGGGAGGAGTCAAGAAGGTGTCAGGGGTTGGTGGTACCACCTATGAGATTTCGGTG  2145