Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11838
• Subject: XM_011516043.1
• Aligned Length: 807
• Identities: 580
• Gaps: 225

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74

Query  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148

Query 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222

Query 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACT-----------------------------------------  255
           |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGTGTTAATTTTCTCAATATTGGGCACATCTTTCAAAGA  296

Query 256  -------------------------------------AAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC  292
                                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGAGAAGGAACCTTTCTCAGGAAGGAGGGAAGAGAAAAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC  370

Query 293  ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC  366
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 371  ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAG------------  432

Query 367  GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA  440
                                                                                     
Sbjct 433  --------------------------------------------------------------------------  432

Query 441  CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT  514
                                                                        |||||||||||||
Sbjct 433  -------------------------------------------------------------GGAAAGCACAGGT  445

Query 515  TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACA  588
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 446  TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACA  519

Query 589  ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTA  662
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520  ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTA  593

Query 663  CGACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  729
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594  CGACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  660