Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11862
- Subject:
- NM_001172122.1
- Aligned Length:
- 1260
- Identities:
- 672
- Gaps:
- 522
Alignment
Query 1 ---------------------------ATGTACCCCCAGTACACTTACTACTATCCTCATTATCTCCAAACCAA 47
|||||||||||||||||.|||||||.||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCAAACGCCTGGATCAGCCACAAATGTACCCCCAGTACACGTACTACTGTCCTCAGTACCTCCAAACCAA 74
Query 48 GCAGTCCTATGCACCAGCTCCCCACCCCATGGCTCCTCCCAGCCCCAGCACAAACAGCAGCAGCAACAACAGCA 121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAGTCCTATGCACCAGCTCCCCACCCCATGGCTCCTCCCAGCCCCAGCACAAACAGCAGCAG----------- 137
Query 122 GCAACAACAGCAGCGGGGAACAGTTGAGTAAAACCAACCTGTACATTCGAGGCCTCCCACCAGGCACCACTGAC 195
|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 138 ----CAACAGCAGCGGGGAACAGTTGAGTAAGACAAACCTATACATCCGAGGACTTCCACCAGGCACCACTGAC 207
Query 196 CAGGACCTAATCAAGCTGTGCCAACCGTATGGAAAAATTGTATCTACAAAGGCAATTCTTGACAAAAACACAAA 269
||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 208 CAGGACCTCATCAAGCTATGTCAACCGTATGGAAAAATCGTATCCACAAAGGCAATTCTTGACAAGAATACGAA 281
Query 270 TCAGTGCAAAGGTTATGGTTTTGTAGATTTTGACAGTCCTGCAGCCGCACAGAAAGCGGTAGCATCTCTCAAGG 343
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||..|.||||
Sbjct 282 TCAGTGCAAAGGTTATGGTTTTGTAGATTTTGATAGTCCTGCAGCCGCACAGAAAGCAGTGGCGTCCTTGAAGG 355
Query 344 CAAATGGCGTGCAGGCACAGATGGCTAAGCAACAAGAGCAAGACCCAACAAACCTATACATCTCAAATCTCCCC 417
|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 356 CAAATGGCGTGCAAGCACAGATGGCCAAGCAACAAGAGCAAGACCCTACGAATCTATACATCTCAAACCTTCCC 429
Query 418 ATTTCTATGGATGAGCAGGAGCTTGAGAATATGCTGAAACCCTTTGGACATGTCATTTCCACAAGAATACTAAG 491
||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 430 ATCTCCATGGATGAGCAGGAGCTGGAGAACATGCTAAAGCCCTTTGGACACGTGATATCCACCAGAATCCTGAG 503
Query 492 AGACGCTAATGGAGTCAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCCAGAATGGAGTCTACTGAAAAATGTGAAGTGGTAATTC 565
.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 504 GGATGCTAACGGAGTCAGCAGGGGCGTTGGCTTTGCCAGAATGGAGTCTACGGAAAAATGTGAAGTGGTGATTC 577
Query 566 AACATTTTAATGGAAAATATCTGAAAACACCACCAGGCATCCCAGCCCCCAGTGAGCCTTTGCTGTGCAAATTC 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 578 AACATTTTAATGGAAAATATCTGAAAACACCACCAGGCATCCCAGCCCCCAGTGAGCCTTTGCTGTGCAAGTTT 651
Query 640 GCTGATGGAGGACAAAAGAAGCGACAGAATCAAAGCAAATATACCCAGAATGGGAGGCCTTGGCCCAGGGAAGG 713
|||||.||||||||.||||||.|||||..|||.|||||..|.||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 652 GCTGACGGAGGACAGAAGAAGAGACAGGGTCAGAGCAAGCACACCCAGAACGGGAGGCCATGGCCCAGAGAAGG 725
Query 714 AGAGGCTGGCATGGCTTTGACCTATGACCCCAC--CTGCC------AA-------------------------- 753
||||||||||||||||.|||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 726 AGAGGCTGGCATGGCTCTGACCTATGACCCCACAGCTGCCCTACAGAACGGATTTTATTCTTCACCGTACAGTC 799
Query 754 -------------------------------------------------------------------------- 753
Sbjct 800 TCGCAACCAACCGCATGATCCCACAGACATCTATCACGCCCTTCATTGCCGCTTCCCCTGTCTCCACATACCAG 873
Query 754 -------------------------------------------------------------------------- 753
Sbjct 874 GTCCAGAGCACGTCATGGACGCCACACCTGCCATACATTATGCAACCAACAGGTGCTGTGATCACACCCGCCGT 947
Query 754 -------------------------------------------------------------------------- 753
Sbjct 948 GGACCACCCCATGTCAATGCAGCCAACTAACATCGTGGGTCCCCTGACGCAGCAGATGAACCATCTTTCCCTGG 1021
Query 754 -------------------------------------------------------------------------- 753
Sbjct 1022 GGACAGCAGGAACGTATATGACTGCTGCTCCTATGCAAGGGACCTACATTCCCCAGTACACGCCTGTGCCTCCG 1095
Query 754 -------------------------------------------------------------------------- 753
Sbjct 1096 ACAGCTGTTTCTATTGAAGGTGTTGTTGCTGATACCTCTCCCCAGACGGTGGCCCCCTCATCCCAGGACAGCAG 1169
Query 754 -------------------------------------------------------------------------- 753
Sbjct 1170 TGGTCAGCAGCAACAGTTAGCAGTGGACACACCCAGTGAACACGCACCGGCATACTCCTTCCAACAGTCCAAAC 1243
Query 754 -- 753
Sbjct 1244 CA 1245