Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11865
• Subject: XM_011539663.1
• Aligned Length: 963
• Identities: 894
• Gaps: 69

Alignment

Query   1  ------ATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGGGAGAAGAAGCAGA----------  58
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct   1  ATGCTGATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGGGAGAAGAAGCAGAAGCCCATCTC  74

Query  59  --------------------------------AGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGGATGGCTG  100
                                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGATGATGAAGCCAGTGATGGGGAAGAAACCCAGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGGATGGCTG  148

Query 101  AGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTG  174
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTG  222

Query 175  GAGCTCTTCTCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCT  248
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GAGCTCTTCTCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCT  296

Query 249  GGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGG  322
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGG  370

Query 323  AACGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGG  396
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AACGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGG  444

Query 397  CTGCTGTGTGTGGCATGTGGTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCA  470
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CTGCTGTGTGTGGCATGTGGTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCA  518

Query 471  CCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGA--------------  530
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 519  CCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGAAGCAGTCCCCTCTG  592

Query 531  -------AGGGTTCCTCACAGATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTG  597
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TTGGGCCAGGGTTCCTCACAGATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTG  666

Query 598  TGCCGGCTCCCAGGGCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTG  671
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TGCCGGCTCCCAGGGCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTG  740

Query 672  TGCCCTGCTCTACTTCACCGGCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGA  745
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  TGCCCTGCTCTACTTCACCGGCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGA  814

Query 746  GTCTGTCAGAACATGCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTG  819
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  GTCTGTCAGAACATGCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTG  888

Query 820  CTGCCCACTCCCACTGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTG  893
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  CTGCCCACTCCCACTGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTG  962

Query 894  G  894
           |
Sbjct 963  G  963