Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11865
Subject:
XM_011539667.1
Aligned Length:
894
Identities:
801
Gaps:
93

Alignment

Query   1  ATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGGGAGAAGAAGCAGAAGGAGGCCTGCAGTAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CCCTGGGATTGGGAAGCGGATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACC  148
                              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------ATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACC  55

Query 149  ATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  56  ATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATG  129

Query 223  TGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130  TGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGG  203

Query 297  CCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204  CCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGA  277

Query 371  AAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGGTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278  AAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGGTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGT  351

Query 445  GGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352  GGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAG  425

Query 519  TCTTCGGCAGGAAGGGTTCCTCACAGATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426  TCTTCGGCAGGAAGGGTTCCTCACAGATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGG  499

Query 593  GGGTGTGCCGGCTCCCAGGGCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500  GGGTGTGCCGGCTCCCAGGGCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTT  573

Query 667  GCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCGGCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574  GCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCGGCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGG  647

Query 741  CATGAGTCTGTCAGAACATGCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648  CATGAGTCTGTCAGAACATGCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCC  721

Query 815  GAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGG  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722  GAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGG  795

Query 889  GACTGG  894
           ||||||
Sbjct 796  GACTGG  801