Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11865
- Subject:
- XM_017016089.1
- Aligned Length:
- 1239
- Identities:
- 894
- Gaps:
- 345
Alignment
Query 1 ------ATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGGGAGAAGAAGCAGA---------- 58
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGGGAGAAGAAGCAGAAGCCCATCTC 74
Query 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Sbjct 75 TGATGATGAAGCCAGTGATGGGGAAGAAACCCAGGTTAGTGCAGCTGATCTGGAAGCCCTCATCAGTGGCCACT 148
Query 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Sbjct 149 ACCCCACCTCCCTTGAGGGAGATTGTGAGCCTAGCCCAGCCCCTGCTGTCCTGGATAAGTGGGTCTGTGCACAG 222
Query 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Sbjct 223 CCCTCAAGCCAGAAGGCGACCAATCACAACCTCCATATCACAGAGAAGCTGGAAGTTCTGGCCAAAGCCTACAG 296
Query 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Sbjct 297 TGTTCAGGGAGACAAGTGGAGGGCCCTGGGCTATGCCAAGGCCATCAATGCCCTCAAGAGCTTCCATAAGCCTG 370
Query 59 ------------AGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGGATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCACCTCGTACCAGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGGATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTG 444
Query 121 GAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTG 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTG 518
Query 195 GGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGG 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGG 592
Query 269 CCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAG 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAG 666
Query 343 GCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGG 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGG 740
Query 417 TTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACC 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACC 814
Query 491 GGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGA---------------------AGGGTTCCTCACA 543
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 815 GGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGAAGCAGTCCCCTCTGTTGGGCCAGGGTTCCTCACA 888
Query 544 GATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTCCCAGGGCCAGG 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTCCCAGGGCCAGG 962
Query 618 GCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCG 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCG 1036
Query 692 GCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAACATGCCCTC 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAACATGCCCTC 1110
Query 766 AGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAA 1184
Query 840 GGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG 894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG 1239