Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11921
• Subject: XM_006722612.3
• Aligned Length: 1192
• Identities: 962
• Gaps: 131

Alignment

Query    1  ATGGCCTCAGCCTGCCCAGGCTCTGATTTCACGTCTATCCATTCAGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCT--TGGA  72
            |||     ||             |||.|.||.|  .|.|||   || ||.|.|.||||||   |||||  ||||
Sbjct    1  ATG-----AG-------------TGACTCCAAG--GAACCA---AG-GGTGCAGCAGCTG---GGCCTCCTGGA  47

Query   73  --------------------------------TTCCGACAGAC-------TCGAG--GAT--------ACAAGA  97
                                            ||||.|.||||       ||.||  |||        ||||||
Sbjct   48  AGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGA  121

Query   98  GCT-TAGCAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCT  170
            ||| || |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||
Sbjct  122  GCTCTA-CAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCT  194

Query  171  GACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCC  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  GACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCC  268

Query  245  AGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTG  318
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  AGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTG  342

Query  319  AAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGC  392
            ||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  343  AAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGC  416

Query  393  TGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAG  466
            |||||||||||||.|.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  417  TGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAG  490

Query  467  TGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGT  540
            ||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||
Sbjct  491  TGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGT  564

Query  541  GAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCT  614
            |||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  565  GAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTT  638

Query  615  TCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCC  688
            .|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||.|.|||||||||||||
Sbjct  639  GCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCC  712

Query  689  ACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCAC  762
            .||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  GCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCAC  786

Query  763  GACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAACTTCCT  836
            ||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  787  GACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCT  860

Query  837  ACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGC  910
            ||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  ACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGC  934

Query  911  AATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGG  984
            ||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||.||||||||....|||
Sbjct  935  AATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGG  1008

Query  985  GAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTG  1058
            .|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||.|||.|.|||||||||
Sbjct 1009  AATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTG  1082

Query 1059  CAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCC  1132
            |||||||.||||||   ||||||.|||.||.|||                                        
Sbjct 1083  CAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA----------------------------------------  1113

Query 1133  CTCCTGCG  1140
                    
Sbjct 1114  --------  1113