Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11945
- Subject:
- NM_016955.4
- Aligned Length:
- 1503
- Identities:
- 1323
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAACCGCGAGAGCTTCGCGGCGGGAGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAGGGCTGTGAGGCCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCGCTCGCATGAGCACCTCATACGGCTGCTTCTGGAGAAGGGCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTA 148
Query 1 --------------------------------ATGGACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAA 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGGACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAA 222
Query 43 AGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGG 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGG 296
Query 117 TGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGG 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGG 370
Query 191 ACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTA 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTA 444
Query 265 ACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAA 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAA 518
Query 339 GTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGC 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGC 592
Query 413 TGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCT 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCT 666
Query 487 ACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACAT 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACAT 740
Query 561 TCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAG 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAG 814
Query 635 TTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCT 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCT 888
Query 709 GGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGA 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGA 962
Query 783 TGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTT 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTT 1036
Query 857 CATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCC 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCC 1110
Query 931 ATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCT 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCT 1184
Query 1005 TTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCA 1258
Query 1079 GAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATG 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATG 1332
Query 1153 CAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAG 1226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAG 1406
Query 1227 TGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTG 1480
Query 1301 ACACATACCAGGATGCTTCTTCA 1323
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACACATACCAGGATGCTTCTTCA 1503