Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11945
• Subject: XM_011513847.2
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1323
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGTTTGTAGACTGTATGCTAACTCGAACCACGAGCTTTCCGCGGAACTTCACAGGTCTCCCTCCTGCCAG  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------------A  1
                                                                                     |
Sbjct   75  CGTTCATGGCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCA  148

Query    2  TGGACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCT  75
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCT  222

Query   76  CGTCGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGG  149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGTCGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGG  296

Query  150  CTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAG  223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAG  370

Query  224  CCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGA  297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGA  444

Query  298  CCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTT  371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTT  518

Query  372  TGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAG  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAG  592

Query  446  TCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGAT  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGAT  666

Query  520  AGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCA  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCA  740

Query  594  GTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGG  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGG  814

Query  668  ACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGC  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGC  888

Query  742  AAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAA  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAA  962

Query  816  TGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAG  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAG  1036

Query  890  AAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGAT  963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGAT  1110

Query  964  GAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGT  1037
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGT  1184

Query 1038  GCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTT  1111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTT  1258

Query 1112  GTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGAC  1185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGAC  1332

Query 1186  AGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGA  1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGA  1406

Query 1260  TATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1470