Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11953
- Subject:
- XM_017019386.2
- Aligned Length:
- 2110
- Identities:
- 1680
- Gaps:
- 413
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTTGTCAGCACATTTACCGATATGGACACTTTTCCCAATAATTTTCCTCCTGGTGGAGACAGTGGATTGAC 74
Query 1 -------------------------ATGTTAATTGATGAAAGGTTACGATGTGAGCATCATAAAGCTAATTATC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGTTCTCAGTCGGAGTTCCAGAAAATGTTAATTGATGAAAGGTTACGATGTGAGCATCATAAAGCTAATTATC 148
Query 50 AGACACTGAAGGCTGAACACACAAGGTTGCAGAATGAACATGTAAAGTTACAAAATGAACTCAAGCACCTGTTT 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGACACTGAAGGCTGAACACACAAGGTTGCAGAATGAACATGTAAAGTTACAAAATGAACTCAAGCACCTGTTT 222
Query 124 AATGAAAAGCAAACTCAGCAGGAAAAACTTCAGCTCCTGCTTGAAGAACTAAGAGGAGAATTAGTAGAGAAAAC 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATGAAAAGCAAACTCAGCAGGAAAAACTTCAGCTCCTGCTTGAAGAACTAAGAGGAGAATTAGTAGAGAAAAC 296
Query 198 TAAAGATTTAGAAGAAATGAAACTGCAGATATTAACTCCACAAAAATTGGAATTGCTAAGAGCCCAAATACAAC 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAAAGATTTAGAAGAAATGAAACTGCAGATATTAACTCCACAAAAATTGGAATTGCTAAGAGCCCAAATACAAC 370
Query 272 AAGAATTAGAAACTCCAATGAGAGAACGTTTTAGGAATCTAGATGAAGAGGTAGAAAAGTATAGAGCTGTATAT 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGAATTAGAAACTCCAATGAGAGAACGTTTTAGGAATCTAGATGAAGAGGTAGAAAAGTATAGAGCTGTATAT 444
Query 346 AATAAGCTTCGCTATGAACATACATTTCTCAAGTCAGAATTTGAACACCAGAAGGAAGAGTATGCACGTATTTT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATAAGCTTCGCTATGAACATACATTTCTCAAGTCAGAATTTGAACACCAGAAGGAAGAGTATGCACGTATTTT 518
Query 420 AGATGAAGGAAAAATAAAATATGAATCAGAGATTGCAAGACTGGAGGAAGATAAAGAAGAACTACGTAACCAGC 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGATGAAGGAAAAATAAAATATGAATCAGAGATTGCAAGACTGGAGGAAGATAAAGAAGAACTACGTAACCAGC 592
Query 494 TGCTTAATGTTGATCTCACAAAAGACAGCAAACGAGTGGAACAACTTGCTCGAGAAAAAGTCTATTTGTGTCAA 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCTTAATGTTGATCTCACAAAAGACAGCAAACGAGTGGAACAACTTGCTCGAGAAAAAGTCTATTTGTGTCAA 666
Query 568 AAATTAAAAGGTTTAGAGGCTGAAGTAGCGGAATTAAAGGCTGAAAAGGAGAATTCTGAGGCTCAGGTGGAAAA 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAATTAAAAGGTTTAGAGGCTGAAGTAGCGGAATTAAAGGCTGAAAAGGAGAATTCTGAGGCTCAGGTGGAAAA 740
Query 642 TGCCCAAAGAATACAGGTGCGGCAGTTGGCTGAGATGCAGGCTACAGTCAGATCCCTGGAGGCTGAAAAACAAT 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCCAAAGAATACAGGTGCGGCAGTTGGCTGAGATGCAGGCTACAGTCAGATCCCTGGAGGCTGAAAAACAAT 814
Query 716 CAGCTAATTTACGGGCAGAACGCTTGGAAAAAGAGCTACAATCAAGCAGTGAACAAAATACCTTTTTAATTAAT 789
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGCTAATTTACGGGCAGAACGTTTGGAAAAAGAGCTACAATCAAGCAGTGAACAAAATACCTTTTTAATTAAT 888
Query 790 AAATTGCATAAAGCTGAACGAGAAATAAATACATTGTCCAGTAAAGTAAAAGAACTTAAACATTCAAACAAACT 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAATTGCATAAAGCTGAACGAGAAATAAATACATTGTCCAGTAAAGTAAAAGAACTTAAACATTCAAACAAACT 962
Query 864 GGAAATAACAGACATCAAACTGGAGACAGCAAGAGCTAAGAGTGAGCTAGAAAGAGAAAGGAATAAGATTCAAA 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAAATAACAGACATCAAACTGGAGACAGCAAGAGCTAAGAGTGAGCTAGAAAGAGAAAGGAATAAGATTCAAA 1036
Query 938 GTGAACTGGATGGATTACAGTCAGACAATGAAATTCTCAAAGCAGCTGTTGAACATCACAAAGTGCTCTTAGTA 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGAACTGGATGGATTACAGTCAGACAATGAAATTCTCAAAGCAGCTGTTGAACATCACAAAGTGCTCTTAGTA 1110
Query 1012 GAAAAGGATCGTGAATTAATACGTAAAGTACAAGCTGCCAAAGAAGAAGGTTATCAAAAACTTGTGGTATTACA 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAAAGGATCGTGAATTAATACGTAAAGTACAAGCTGCCAAAGAAGAAGGTTATCAAAAACTTGTGGTATTACA 1184
Query 1086 AGATGAAAAGTTAGAACTCGAGAACAGATTAGCAGATTTGGAGAAAATGAAAGTGGAACATGATGTCTGGAGGC 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGATGAAAAGTTAGAACTCGAGAACAGATTAGCAGATTTGGAGAAAATGAAAGTGGAACATGATGTCTGGAGGC 1258
Query 1160 AATCTGAAAAGGATCAGTATGAAGAGAAATTGCGGGCTTCACAGATGGCAGAAGAGATCACCAGGAAGGAGCTT 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AATCTGAAAAGGATCAGTATGAAGAGAAATTGCGGGCTTCACAGATGGCAGAAGAGATCACCAGGAAGGAGCTT 1332
Query 1234 CAGAGTGTTAGGTTAAAACTTCAGCAACAAATTGTGACTATTGAAAATGCAGAGAAGGAAAAAAATGAAAATTC 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGAGTGTTAGGTTAAAACTTCAGCAACAAATTGTGACTATTGAAAATGCAGAGAAGGAAAAAAATGAAAATTC 1406
Query 1308 TGACCTAAAACAGCAAATCAGTAGTTTGCAGATCCAAGTGACTTCACTTGCACAGTCAGAGAATGACTTGCTGA 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACCTAAAACAGCAAATCAGTAGTTTGCAGATCCAAGTGACTTCACTTGCACAGTCAGAGAATGACTTGCTGA 1480
Query 1382 ATTCAAACCAAATGCTGAAGGAAATGGTGGAGAGATTAAAACAAGAATGCCGAAATTTTAGAAGCCAAGCTGAA 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATTCAAACCAAATGCTGAAGGAAATGGTGGAGAGATTAAAACAAGAATGCCGAAATTTTAGAAGCCAAGCTGAA 1554
Query 1456 AAAGCGCAACTAGAAGCTGAAAAGACATTGGAAGAGAAACAGATACAGTGGTTGGAAGAAAAGCATAAGCTTCA 1529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAAGCGCAACTAGAAGCTGAAAAGACATTGGAAGAGAAACAGATACAGTGGTTGGAAGAAAAGCATAAGCTTCA 1628
Query 1530 TGAGCGTATCACAGACAGAGAAGAAAAGTACAATCAAGCTAAGGAGAAACTGCAGCGAGCTGCAATTGCCCAGA 1603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGAGCGTATCACAGACAGAGAAGAAAAGTACAATCAAGCTAAGGAGAAACTGCAGCGAGCTGCAATTGCCCAGA 1702
Query 1604 AAAAG---------CTTGA---------------------ACAGGA-----------TCTT------------- 1623
||||| |||.| |||.|| ||||
Sbjct 1703 AAAAGAGAAAATCTCTTCATGAAAACAAATTGAAAAGACTACAAGAGAAAGTAGAAGTCTTGGAGGCAAAGAAA 1776
Query 1624 ---GAGTTGG-----------------------------GATG-CCCTTCTG-TGACTGATAC----------- 1652
||.|||| .||| .||||.|| .|||| ||||
Sbjct 1777 GAAGAATTGGAAACAGAAAATCAGGTCTTAAATAGACAAAATGTTCCTTTTGAAGACT-ATACAAGGCTTCAAA 1849
Query 1653 --------------ATACAGAGA-----------------GAGTGTA-------TTCCCCCCA--CCCCCATTG 1686
||||||||| .|||.|| ||||...|| ||.|||
Sbjct 1850 AAAGACTAAAAGATATACAGAGAAGACATAATGAATTTCGAAGTCTAATTTTGGTTCCTAACATGCCTCCA--- 1920
Query 1687 AAGAGAG-ATCT--------------CTTGAAG----------------------------------------- 1704
|.|| |||| |||..||
Sbjct 1921 ---ACAGCATCTATCAATCCTGTTAGCTTTCAGTCATCAGCCATGGTTCCAAGCATGGAACTACCATTTCCTCC 1991
Query 1705 -------------------------------------------------------------------------- 1704
Sbjct 1992 TCATATGCAGGAGGAACAACATCAAAGGGAACTCTCTCTACTTCGCAAAAGACTAGAAGAACTGGAAACAACAC 2065
Query 1705 -------------------------------------- 1704
Sbjct 2066 AAAGAAAACAACTAGAGGAACTTGGATCTTCCGGAGAA 2103