Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11953
- Subject:
- XM_024449005.1
- Aligned Length:
- 2011
- Identities:
- 1365
- Gaps:
- 629
Alignment
Query 1 ATGTTAATTGATGAAAGGTTACGATGTGAGCATCATAAAGCTAATTATCAGACACTGAAGGCTGAACACACAAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTTGCAGAATGAACATGTAAAGTTACAAAATGAACTCAAGCACCTGTTTAATGAAAAGCAAACTCAGCAGGAAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACTTCAGCTCCTGCTTGAAGAACTAAGAGGAGAATTAGTAGAGAAAACTAAAGATTTAGAAGAAATGAAACTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGATATTAACTCCACAAAAATTGGAATTGCTAAGAGCCCAAATACAACAAGAATTAGAAACTCCAATGAGAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ACGTTTTAGGAATCTAGATGAAGAGGTAGAAAAGTATAGAGCTGTATATAATAAGCTTCGCTATGAACATACAT 370
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------ATG--GAGGTAGAAAAGTATAGAGCTGTATATAATAAGCTTCGCTATGAACATACAT 55
Query 371 TTCTCAAGTCAGAATTTGAACACCAGAAGGAAGAGTATGCACGTATTTTAGATGAAGGAAAAATAAAATATGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 TTCTCAAGTCAGAATTTGAACACCAGAAGGAAGAGTATGCACGTATTTTAGATGAAGGAAAAATAAAATATGAA 129
Query 445 TCAGAGATTGCAAGACTGGAGGAAGATAAAGAAGAACTACGTAACCAGCTGCTTAATGTTGATCTCACAAAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 TCAGAGATTGCAAGACTGGAGGAAGATAAAGAAGAACTACGTAACCAGCTGCTTAATGTTGATCTCACAAAAGA 203
Query 519 CAGCAAACGAGTGGAACAACTTGCTCGAGAAAAAGTCTATTTGTGTCAAAAATTAAAAGGTTTAGAGGCTGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CAGCAAACGAGTGGAACAACTTGCTCGAGAAAAAGTCTATTTGTGTCAAAAATTAAAAGGTTTAGAGGCTGAAG 277
Query 593 TAGCGGAATTAAAGGCTGAAAAGGAGAATTCTGAGGCTCAGGTGGAAAATGCCCAAAGAATACAGGTGCGGCAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 TAGCGGAATTAAAGGCTGAAAAGGAGAATTCTGAGGCTCAGGTGGAAAATGCCCAAAGAATACAGGTGCGGCAG 351
Query 667 TTGGCTGAGATGCAGGCTACAGTCAGATCCCTGGAGGCTGAAAAACAATCAGCTAATTTACGGGCAGAACGCTT 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 352 TTGGCTGAGATGCAGGCTACAGTCAGATCCCTGGAGGCTGAAAAACAATCAGCTAATTTACGGGCAGAACGTTT 425
Query 741 GGAAAAAGAGCTACAATCAAGCAGTGAACAAAATACCTTTTTAATTAATAAATTGCATAAAGCTGAACGAGAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 GGAAAAAGAGCTACAATCAAGCAGTGAACAAAATACCTTTTTAATTAATAAATTGCATAAAGCTGAACGAGAAA 499
Query 815 TAAATACATTGTCCAGTAAAGTAAAAGAACTTAAACATTCAAACAAACTGGAAATAACAGACATCAAACTGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 TAAATACATTGTCCAGTAAAGTAAAAGAACTTAAACATTCAAACAAACTGGAAATAACAGACATCAAACTGGAG 573
Query 889 ACAGCAAGAGCTAAGAGTGAGCTAGAAAGAGAAAGGAATAAGATTCAAAGTGAACTGGATGGATTACAGTCAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 ACAGCAAGAGCTAAGAGTGAGCTAGAAAGAGAAAGGAATAAGATTCAAAGTGAACTGGATGGATTACAGTCAGA 647
Query 963 CAATGAAATTCTCAAAGCAGCTGTTGAACATCACAAAGTGCTCTTAGTAGAAAAGGATCGTGAATTAATACGTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 CAATGAAATTCTCAAAGCAGCTGTTGAACATCACAAAGTGCTCTTAGTAGAAAAGGATCGTGAATTAATACGTA 721
Query 1037 AAGTACAAGCTGCCAAAGAAGAAGGTTATCAAAAACTTGTGGTATTACAAGATGAAAAGTTAGAACTCGAGAAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 AAGTACAAGCTGCCAAAGAAGAAGGTTATCAAAAACTTGTGGTATTACAAGATGAAAAGTTAGAACTCGAGAAC 795
Query 1111 AGATTAGCAGATTTGGAGAAAATGAAAGTGGAACATGATGTCTGGAGGCAATCTGAAAAGGATCAGTATGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 AGATTAGCAGATTTGGAGAAAATGAAAGTGGAACATGATGTCTGGAGGCAATCTGAAAAGGATCAGTATGAAGA 869
Query 1185 GAAATTGCGGGCTTCACAGATGGCAGAAGAGATCACCAGGAAGGAGCTTCAGAGTGTTAGGTTAAAACTTCAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 GAAATTGCGGGCTTCACAGATGGCAGAAGAGATCACCAGGAAGGAGCTTCAGAGTGTTAGGTTAAAACTTCAGC 943
Query 1259 AACAAATTGTGACTATTGAAAATGCAGAGAAGGAAAAAAATGAAAATTCTGACCTAAAACAGCAAATCAGTAGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 AACAAATTGTGACTATTGAAAATGCAGAGAAGGAAAAAAATGAAAATTCTGACCTAAAACAGCAAATCAGTAGT 1017
Query 1333 TTGCAGATCCAAGTGACTTCACTTGCACAGTCAGAGAATGACTTGCTGAATTCAAACCAAATGCTGAAGGAAAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TTGCAGATCCAAGTGACTTCACTTGCACAGTCAGAGAATGACTTGCTGAATTCAAACCAAATGCTGAAGGAAAT 1091
Query 1407 GGTGGAGAGATTAAAACAAGAATGCCGAAATTTTAGAAGCCAAGCTGAAAAAGCGCAACTAGAAGCTGAAAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 GGTGGAGAGATTAAAACAAGAATGCCGAAATTTTAGAAGCCAAGCTGAAAAAGCGCAACTAGAAGCTGAAAAGA 1165
Query 1481 CATTGGAAGAGAAACAGATACAGTGGTTGGAAGAAAAGCATAAGCTTCATGAGCGTATCACAGACAGAGAAGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 CATTGGAAGAGAAACAGATACAGTGGTTGGAAGAAAAGCATAAGCTTCATGAGCGTATCACAGACAGAGAAGAA 1239
Query 1555 AAGTACAATCAAGCTAAGGAGAAACTGCAGCGAGCTGCAATTGCCCAGAAAAAG---------CTTGA------ 1613
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.|
Sbjct 1240 AAGTACAATCAAGCTAAGGAGAAACTGCAGCGAGCTGCAATTGCCCAGAAAAAGAGAAAATCTCTTCATGAAAA 1313
Query 1614 ---------------ACAGGA-----------TCTT----------------GAGTTGG--------------- 1630
|||.|| |||| ||.||||
Sbjct 1314 CAAATTGAAAAGACTACAAGAGAAAGTAGAAGTCTTGGAGGCAAAGAAAGAAGAATTGGAAACAGAAAATCAGG 1387
Query 1631 --------------GATG-CCCTTCTG-TGACTGATAC-------------------------ATACAGAGA-- 1661
.||| .||||.|| .|||| |||| |||||||||
Sbjct 1388 TCTTAAATAGACAAAATGTTCCTTTTGAAGACT-ATACAAGGCTTCAAAAAAGACTAAAAGATATACAGAGAAG 1460
Query 1662 ---------------GAGTGTA-------TTCCCCCCA--CCCCCATTGAAGAGAG-ATCT------------- 1697
.|||.|| ||||...|| ||.||| |.|| ||||
Sbjct 1461 ACATAATGAATTTCGAAGTCTAATTTTGGTTCCTAACATGCCTCCA------ACAGCATCTATCAATCCTGTTA 1528
Query 1698 -CTTGAAG------------------------------------------------------------------ 1704
|||..||
Sbjct 1529 GCTTTCAGTCATCAGCCATGGTTCCAAGCATGGAACTACCATTTCCTCCTCATATGCAGGAGGAACAACATCAA 1602
Query 1705 -------------------------------------------------------------------------- 1704
Sbjct 1603 AGGGAACTCTCTCTACTTCGCAAAAGACTAGAAGAACTGGAAACAACACAAAGAAAACAACTAGAGGAACTTGG 1676
Query 1705 ------------- 1704
Sbjct 1677 ATCTTCCGGAGAA 1689