Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11987
• Subject: NM_016309.3
• Aligned Length: 1084
• Identities: 968
• Gaps: 95

Alignment

Query    1  AT-GCTTCCCTGTGCA-AGAGAACTC--CCATCAGCAGCGCCCGACAGCACTCTCCTCCTCACTGCCCAACACT  70
            || ||  |.||..||| ||.||| ||  |.||||                    |||||| .|||         
Sbjct    1  ATGGC--CACTAGGCAGAGGGAA-TCCTCTATCA--------------------CCTCCT-GCTG---------  41

Query   71  GGGTGGCAAATCTTTTCATCTTG----GCCACTCTGATAGGCTGGACAGTGAGGTCCTTCTTCCTAGGGCGCAT  140
                         ||.||.||.|    ||.||.|.||      .|||   ||||.|          |.||||  
Sbjct   42  -------------TTCCACCTCGAGCTGCGACGCAGA------CGAC---GAGGGC----------GTGCGC--  81

Query  141  GGAAACCT-----GTTGCAGTCACCTGGGTTTGCGGAGTGGGAGGAGGTTTGCAGTAAGCATTGGCTACTGGCA  209
             |..||||     |.|||  |..||||    |||        |.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   82  -GGCACCTGCGAAGATGC--TTCCCTG----TGC--------AAGAGGTTTGCAGTAAGCATTGGCTACTGGCA  140

Query  210  TGACCCTTACATACAGCACTTTGTGAGACTGTCTAAAGAGAGGAAAGCCCCTGAAATCAACAGAGGATATTTTG  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  TGACCCTTACATACAGCACTTTGTGAGACTGTCTAAAGAGAGGAAAGCCCCTGAAATCAACAGAGGATATTTTG  214

Query  284  CTCGAGTCCATGGTGTCAGTCAGCTTATAAAGGCATTTCTACGGAAGACAGAATGTCATTGTCAAATTGTCAAC  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  CTCGAGTCCATGGTGTCAGTCAGCTTATAAAGGCATTTCTACGGAAGACAGAATGTCATTGTCAAATTGTCAAC  288

Query  358  CTTGGGGCAGGCATGGATACCACCTTCTGGAGATTAAAGGATGAAGATCTTCTCCCAAGTAAATATTTTGAGGT  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  CTTGGGGCAGGCATGGATACCACCTTCTGGAGATTAAAGGATGAAGATCTTCTCCCAAGTAAATATTTTGAGGT  362

Query  432  TGACTTTCCAATGATTGTCACGAGAAAGCTGCACAGTATCAAATGCAAGCCTCCCCTATCCAGCCCCATTCTAG  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  TGACTTTCCAATGATTGTCACGAGAAAGCTGCACAGTATCAAATGCAAGCCTCCCCTATCCAGCCCCATTCTAG  436

Query  506  AACTGCATTCAGAGGACACACTTCAGATGGATGGACACATACTGGATTCAAAGAGATATGCCGTTATTGGAGCA  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  AACTGCATTCAGAGGACACACTTCAGATGGATGGACACATACTGGATTCAAAGAGATATGCCGTTATTGGAGCA  510

Query  580  GATCTCCGAGACCTGTCTGAACTGGAAGAGAAGCTAAAGAAATGTAACATGAATACACAATTGCCAACACTCCT  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  GATCTCCGAGACCTGTCTGAACTGGAAGAGAAGCTAAAGAAATGTAACATGAATACACAATTGCCAACACTCCT  584

Query  654  GATAGCTGAATGTGTGCTGGTTTACATGACTCCAGAGCAGTCCGCAAACCTCCTGAAGTGGGCAGCCAACAGTT  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  GATAGCTGAATGTGTGCTGGTTTACATGACTCCAGAGCAGTCCGCAAACCTCCTGAAGTGGGCAGCCAACAGTT  658

Query  728  TTGAGAGAGCCATGTTCATAAACTACGAACAGGTGAACATGGGTGATCGGTTTGGGCAGATCATGATTGAAAAC  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TTGAGAGAGCCATGTTCATAAACTACGAACAGGTGAACATGGGTGATCGGTTTGGGCAGATCATGATTGAAAAC  732

Query  802  CTGCGGAGACGCCAGTGTGACCTGGCGGGAGTGGAGACCTGCAAGTCATTAGAGTCACAGAAAGAACGGCTCCT  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  CTGCGGAGACGCCAGTGTGACCTGGCGGGAGTGGAGACCTGCAAGTCATTAGAGTCACAGAAAGAACGGCTCCT  806

Query  876  GTCGAATGGGTGGGAAACAGCATCGGCCGTCGACATGATGGAGTTGTACAACAGGTTACCTCGAGCTGAAGTGA  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  GTCGAATGGGTGGGAAACAGCATCGGCCGTCGACATGATGGAGTTGTACAACAGGTTACCTCGAGCTGAAGTGA  880

Query  950  GCAGGATAGAATCACTTGAATTCCTGGATGAAATGGAGCTGCTGGAGCAGCTCATGCGGCATTACTGCCTTTGC  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  GCAGGATAGAATCACTTGAATTCCTGGATGAAATGGAGCTGCTGGAGCAGCTCATGCGGCATTACTGCCTTTGC  954

Query 1024  TGGGCAACCAAAGGAGGAAATGAGCTTGGGCTGAAGGAGATAACTTAT  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  TGGGCAACCAAAGGAGGAAATGAGCTTGGGCTGAAGGAGATAACTTAT  1002