Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12029
• Subject: NM_001347216.1
• Aligned Length: 1112
• Identities: 874
• Gaps: 175

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGGAAGGTGACGCCATCTGGGCCCCACCCATCCTTCCTCACAGCACCCTCGGCACCTTAAGCCACCACCC  74

Query    1  ----------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC  52
                                  |||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TGAGCTACATTTTGGAGGGAAGATGGAATCTAAGGTCTCGGAAGGTGGCCTGAACGTAACCCTGACCATCCGCC  148

Query   53  TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG  126
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TACTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACAGTAAAGAAGATGCGTGAAGAG  222

Query  127  AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC  200
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AGTGGCGCCAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGAATCGTTACAATCACAGGCCCAACTGACGC  296

Query  201  CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG  274
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCTTCAAGGCCTTTGCTATGATCGCGTACAAGTTTGAGGAGGACATCATTAATTCCATGAGCAACAGCCCTG  370

Query  275  CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA  348
            |||||||||||||.||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CCACCAGCAAGCCTCCAGTGACACTGCGACTAGTGGTCCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGT  444

Query  349  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC  422
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCCGGGAGTCCACAGGTGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGTGACATGCTGCCCAACTC  518

Query  423  CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA  496
            |||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGAGCGGGCAGTGACTATCTCAGGGACCCCAGACGCCATCATCCAGTGTGTGAAACAGATCTGTGTGGTCA  592

Query  497  TGCTGG--------------------------------------------------------------------  502
            ||||||                                                                    
Sbjct  593  TGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCA  666

Query  503  -------AGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGC  569
                   |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGGTCAGGCCTACACAATCCAGGGACAGTACGCCATCCCCCACCCAGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGC  740

Query  570  CATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACT  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACT  814

Query  644  CCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAG  717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCGTCAGGTCTGGATGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAG  888

Query  718  CTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGAT  791
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  CTCACCATTCCCAATGATCTTATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGCACCAAAATCAATGAAATCCGACAGAT  962

Query  792  GTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCC  865
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  GTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAATGCCACTGAAGGGTCGTCAGAGCGCCAGATTACCATCACAGGGACCC  1036

Query  866  CGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGG--GCACGC  937
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||  ||||.|
Sbjct 1037  CAGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCTAGGCTGACGTCTGAGGTCACCGGGATGGGTGCACTC  1110

Query  938  TG  939
              
Sbjct 1111  --  1110