Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12167
- Subject:
- XM_011246731.2
- Aligned Length:
- 1919
- Identities:
- 1573
- Gaps:
- 124
Alignment
Query 1 ------ATGATTGCTAAAGACAAAGACACGCTTGACTTCATTCGG----AACTTGTGCCAGAAGAGACATGTTT 64
||.||| ||.||| |||.|| |||.| |||.||| |||
Sbjct 1 ATGGGCATCATT-----AGCCAA----------------ATTTGGTGTAAACAT--------AGATACA--TTT 43
Query 65 GTATCCAGTCATCTCTGGCAAAAGTATCCTCAAAAAAGGTAAATGAGAAAGATGTTGATAAGTTTCTGCTCTAC 138
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||.|||.|||
Sbjct 44 GTATCCAGTCATCTCTTGCAAAAGTATCCTCAAAAAAAGTAAATGAGAAGGAAGTTGATAAGTTTCAGCTTTAC 117
Query 139 CAGCATTTTTCCTGCAACATAAGAAACATTCACCATCATCAGATTCTGGCAATTAACCGTGGAGAAAATTTGAA 212
|||.||||.||||||||||||||.|.|||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 118 CAGAATTTCTCCTGCAACATAAGGACCATCCACCATCACCAGATTCTGGCCATTAACCGAGGAGAGAATTTGAA 191
Query 213 GGTACTGACGGTTAAGGTCAATATTTCTGATGGAGTGAAGGATGAATTCTGTAGGTGGTGCATCCAAAACAGGT 286
|.|.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||.|.|||||||||.|.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 192 GATCCTGACCGTCAAAGTCAACATTTCTGATGGAGTAAAGAACGAATTCTGTCGATGGTGTATACAGAACAGGT 265
Query 287 GGAGACCACGTAGCTTTGCAAGGCCAGAGTTAATGAAGATCTTATATAATTCACTGAATGATTCCTTTAAACGC 360
||||.||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||.|||
Sbjct 266 GGAGGCCACGTGGCTTTGCACGGCCAGAGTTGATGAAGATCTTACATAATTCACTGGATGACTCCTTTAAGCGC 339
Query 361 CTTATTTATCCTCTTCTCTGTAGAGAATTCAGAGCCAAACTAACATCAGATGCAGAGAAGGAATCAGTAATGAT 434
||.|||..||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 340 CTCATTGTTCCTCTCCTCTGTAGAGAGTTCAGAGCCAAACTGACATCAGATGCAGAGAAGCAATCAGTAATGAT 413
Query 435 GTTTGGACGGAACCTTCGTCAGCTCCTTTTAACAAGCCCTGTTCCAGGGCGCACCTTAATGGGAGTGGATCCTG 508
||||||||.||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|.||||||||.|||||||
Sbjct 414 GTTTGGACAGAACCTCCGCCAGCTCCTTTTAACAAGTCCTGTGCCAGGCCGCACCCTGATGGGAGTAGATCCTG 487
Query 509 GTTATAAACATGGTTGCAAATTAGCTATAATTTCTCCTACTAGTCAGATACTTCATACTGATGTGGTTTACTTG 582
|.||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 488 GCTACAAACATGGATGCAAACTAGCCATCATTTCTCCTACTAGTCAGATCCTTCACACGGATGTGGTTTACTTG 561
Query 583 CATTGTGGACAAGGCTTCCGAGAGGCGGAGAAAATAAAGACACTTTTGCTGAATTTCAACTGCAGCACAGTAGT 656
||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||..|||||||||.|||||||||||||.|||||.||
Sbjct 562 CACTGTGGACAAGGCTTCCGAGAGGCCGAGAAGATCAAGAGGCTTTTGCTGCATTTCAACTGCAGAACAGTGGT 635
Query 657 GATTGGAAATGGAACTGCCTGCAGGGAAACAGAAGCTTACTTTGCTGACCTGATAATGAAGAATTATTTTGCAC 730
|||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 636 GATCGGAAATGGAACTGCCTGCCGGGAAACTGAAGCCTACTTTGCTGACCTGATAATGAAAAATTACTTTGCAC 709
Query 731 CACTGGATGTTGTTTACTGTATCGTCAGTGAAGCAGGAGCATCAATCTACAGTGTCAGCCCTGAAGCTAACAAA 804
||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 710 CACTGGATGTCGTTTACTGCATCGTCAGTGAAGCAGGGGCCTCCATCTACAGTGTCAGCCCCGAAGCGAACAAG 783
Query 805 GAGATGCCAGGGCTGGACCCTAATTTGAGAAGTGCAGTTTCCATAGCAAGGCGTGTACAAGATCCATTAGCTGA 878
|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 784 GAGATGCCAGGACTGGACCCTAACTTGAGAAGTGCAGTTTCCATAGCAAGGCGTGTTCAAGATCCATTAGCTGA 857
Query 879 GCTAGTGAAAATTGAGCCAAAGCACATTGGAGTTGGAATGTATCAGCATGACGTATCCCAGACTTTACTCAAGG 952
||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 858 GCTAGTGAAATTTGACCCGAAGCACATTGGAGTTGGAATGTATCAGCATGATGTATCCCAGACATTACTCAAGG 931
Query 953 CAACACTGGACAGTGTTGTAGAAGAATGTGTCAGCTTTGTGGGAGTGGATATTAACATCTGTTCAGAAGTTTTG 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 932 CAACACTGGACAGTGTTGTAGAAGAATGTGTCAGCTTTGTGGGAGTGGATATTAACATTTGTTCTGAGGTTTTG 1005
Query 1027 TTAAGGCATATTGCAGGACTCAATGCCAACAGGGCCAAAAATATTATTGAATGGCGAGAGAAAAATGGACCCTT 1100
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1006 TTAAGGCATATTGCAGGACTCAATGCCAATAGAGCCAAAAATATTATTGAGTGGCGAGAGAAAAATGG-CCCTT 1078
Query 1101 T-ATCAACCGAGAACAGCTGAAGAAAGTGAAAGGGCTGGGCCCAAAATCCTTCCAACAGTGTGCTGGCTTCATC 1173
| ||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1079 TCATTAACCGAGAACAGTTGAAGAAGGTGAAAGGGCTTGGTCCAAAATCCTTCCAGCAGTGTGCTGGCTTCGTC 1152
Query 1174 AGAATCAACCAGGATTATATCCGAACGTTTTGCAGTCAGCAAACTGAAACTTCAGGCCAAATTCAAGGAGTTGC 1247
||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|.|..|||
Sbjct 1153 AGGATCAACCAGGATTACATCCGGACATTCTGCAGTCAACACACTGACTCTTCAGGCCAGAGCCAGGAAACTGC 1226
Query 1248 TGTGACATCTTCAGCAGACGTTGAGGTCACAAATGAGAAGCAGGGCAAAAAGAAGAGCAAAACTGCAGTGAATG 1321
||| |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||| |||| |||
Sbjct 1227 -----CAT----------------GGTCACAAATGAGAAGCTGGGCAAAAAGAAGAACAAA---GCAG---ATG 1273
Query 1322 TTTTACTGAAGCCAAATCCTTTGGACCAAACTTGTATTCATCCAGAATCATATGACATAGCAATGA-------- 1387
.....||.|..|||||.||..|||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|
Sbjct 1274 CCACCCTCATACCAAACCCACTGGACCAGACTTGCATCCATCCGGAATCCTATGACATAGCAGTCAGTAAAAGA 1347
Query 1388 ----------------------------------GGTTTTTGTCATCCATTGGAGGGACACTGTATGAGGTTGG 1427
|||||||.||.|.||||||.||||||.|||.||||.||||
Sbjct 1348 GACACTAATTTCTGGAGCCTCTACATTCTATACTGGTTTTTATCGTTCATTGGGGGGACAATGTGTGAGATTGG 1421
Query 1428 AAAGCCTGAAATGCAACAAAAAATAAATTCAT-TC-CTTGAAAAGGAAGGAATGGAGAAAATTGCAGAAAGATT 1499
|||||||||||||||.||.|||||||| |.| || ||.|..||.|||||.||.|||.|||.|||.|||||.||
Sbjct 1422 AAAGCCTGAAATGCAGCAGAAAATAAA--CGTGTCTCTCGGGAAAGAAGGCATAGAGGAAACTGCTGAAAGGTT 1493
Query 1500 GCAAACAACAGTACACACCTTACAGGTCATCATAGATGGTCTCAGCCAGCCTGAAAGCTTTGACTTTCGAACAG 1573
.||.|||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||.||.||||||||..|||.|||||||.|.|||||||
Sbjct 1494 ACAGACAACTGTGCACACACTGCAGGTCATCATAGATGGACTGAGCCAGCCCAAAACCTTTGACATCCGAACAG 1567
Query 1574 ATTTTGATAAACCTGATTTCAAGAGAAGCATAGTATGCCTGGAAGATCTGCAGATTGGGACAGTTCTTACAGGC 1647
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1568 ATTTTGATAAGCCTGACTTCAAGAGAAGCATAGTGTGTCTGGAAGACCTGCAGGTTGGGACAGTTCTTACAGGC 1641
Query 1648 AAAGTTGAGAATGCCACTCTCTTTGGAATTTTTGTGGATATAGGAGTGGGGAAATCTGGGCTGATTCCCATACG 1721
|||||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||.||
Sbjct 1642 AAAGTGGAGAATGCTACTCTGTTTGGGGTCTTTGTGGATATAGGAGTGGGGAAGGCGGGGCTGATTCCTATCCG 1715
Query 1722 AAATG----TAACAGAAGCAAAACTTTCAAAAACAAAGAAGAGAAGAAGCCTTGGACTGGGCCCCGGAGAAAGA 1791
| ||||||||||.||.||.||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.|.|
Sbjct 1716 ----GTTCATAACAGAAGCCAAGCTGTCCAAAACAAAGAGGAGAAGAAGCCTGGGCCTGGGCCCCGGAGAGAAA 1785
Query 1792 GTGGAAGTCCAAGTACTCAACATTGACATCCCCCGATCTAGGATTACTCTGGACCTCATTCGGGTGTTA 1860
|||||.||..||||.|||||..|.|||||.|||||||||.|||||.|.||.||||||.|.||||||||.
Sbjct 1786 GTGGAGGTGAAAGTCCTCAATGTCGACATTCCCCGATCTCGGATTTCGCTCGACCTCCTCCGGGTGTTG 1854