Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12171
Subject:
NM_001370537.1
Aligned Length:
749
Identities:
494
Gaps:
253

Alignment

Query   1  MASSQGGPALLQPVPADVVSSQGVPSILQPAPAEVISSQATPPLLQPAPQLSVDLTEVEVLGEDTVENINPRTS  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  EQHRQGSDGNHTIPASSLHSMTNFISGLQRLHGMLEFLRPSSSNHSVGPMRTRRRVSASRRARAGGSQRTDSAR  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  LRAPLDAYFQVSRTQPDLPATTYDSETRNPVSEELQVSSSSDSDSDSSAEYGGVVDQAEESGAVILEEQLAGVS  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  AEQEVTCIDGGKTLPKQPSPQKSEPLLPSASMDEEEGDTCTICLEQWTNAGDHRLSALRCGHLFGYRCISTWLK  296
                                          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------MDEEEGDTCTICLEQWTNAGDHRLSALRCGHLFGYRCISTWLK  43

Query 297  GQVRKCPQCNKKARHSDIVVLYARTLRALDTSEQERMKSSLLKEQMLRKQAELESAQCRLQLQVLTDKCTKLQR  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  44  GQVRKCPQCNKKARHSDIVVLYARTLRALDTSEQERMKSSLLKEQMLRKQAELESAQCRLQLQVLTDKCTRLQR  117

Query 371  RVQDLQKLTSHQSQNLQQPRGSQAWVLSCSPSSQGQHKHKYHFQKTFTVSQAGNCRIMAYCDALSCLVISQPSP  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118  RVQDLQKLTSHQSQNLQQPRGSQAWVLSCSPSSQGQHKHKYHFQKTFTVSQAGNCRIMAYCDALSCLVISQPSP  191

Query 445  QASFLPGFGVKMLSTANMKSSQYIPMHGKQIRGLAFSSYLRGLLLSASLDNTIKLTSLETNTVVQTYNAGRPVW  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192  QASFLPGFGVKMLSTANMKSSQYIPMHGKQIRGLAFSSYLRGLLLSASLDNTIKLTSLETNTVVQTYNAGRPVW  265

Query 519  SCCWCLDEANYIYAGLANGSILVYDVRNTSSHVQELVAQKARCPLVSLSYMPRAASAAFPYGGVLAGTLEDASF  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266  SCCWCLDEANYIYAGLANGSILVYDVRNTSSHVQELVAQKARCPLVSLSYMPRAASAAFPYGGVLAGTLEDASF  339

Query 593  WEQKMDFSHWPHVLPLEPGGCIDFQTENSSRHCLVTYRPDKNHTTIRSVLMEMSYRLDDTGNPICSCQPVHTFF  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340  WEQKMDFSHWPHVLPLEPGGCIDFQTENSSRHCLVTYRPDKNHTTIRSVLMEMSYRLDDTGNPICSCQPVHTFF  413

Query 667  GGPTCKLLTKNAIFQSPENDGNILVCTGDEAANSALLWDAASGSLLQDLQTDQPVLDICPFEVNRNSYLATLTE  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414  GGPTCKLLTKNAIFQSPENDGNILVCTGDEAANSALLWDAASGSLLQDLQTDQPVLDICPFEVNRNSYLATLTE  487

Query 741  KMVHTYKWE  749
           ||||.||||
Sbjct 488  KMVHIYKWE  496