Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12193
- Subject:
- NM_001369346.1
- Aligned Length:
- 1377
- Identities:
- 917
- Gaps:
- 459
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MLHTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDGGSNKEGKKSRWK 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 RKVSSSSPQSGCPSPTIPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQQCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSV 148
Query 1 ------------------------------------------------------MKRTKCADIDVETPDSILVN 20
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Sbjct 149 PAKPATWEGKQSDGQTGSPQNSNSSFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVN 222
Query 21 TNLRALINKHTFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQV 94
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Sbjct 223 TNLRALINKHTFSVLPGDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQV 296
Query 95 RIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQ 168
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Sbjct 297 RIRQEIEKEKKVEPWKEQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQ 370
Query 169 SECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESE 242
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Sbjct 371 SECKEEALQMSSPGRKEECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESE 444
Query 243 KNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEE 316
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Sbjct 445 KNHLTTASNYNKSESQESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEE 518
Query 317 APVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPN 390
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Sbjct 519 APVSWEKRPRVTENRQHQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPN 592
Query 391 RTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRVSETG 464
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Sbjct 593 RTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRVSETG 666
Query 465 KGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPVHI 538
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Sbjct 667 KGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHI 740
Query 539 EKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPT------------------------------------ 576
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Sbjct 741 EKLDNEKLNPTRATATVASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASS 814
Query 577 -------------------------------------------------------------------------- 576
Sbjct 815 KTDASVPVAVTPSPLTSLLTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSI 888
Query 577 -------------------------------------------------------------------------- 576
Sbjct 889 PANNPLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQL 962
Query 577 -------------------------------------------------------------------------G 577
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Sbjct 963 GKTLQSKQLPQVPRPLQLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSG 1036
Query 578 FQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKN 651
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Sbjct 1037 FQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKN 1110
Query 652 ATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTT 725
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Sbjct 1111 ATGESSSSKEDDTDEESTGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTT 1184
Query 726 LSKENYLFTRGQTFDEKTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKL 799
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Sbjct 1185 LSKENYLFTRGQTFDEKTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKL 1258
Query 800 YGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSEE 873
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Sbjct 1259 YGSPTQIGPSYRGMINVSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSEE 1332
Query 874 NSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR 918
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Sbjct 1333 NSIEGTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR 1377