Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12211
- Subject:
- NM_001039371.2
- Aligned Length:
- 1641
- Identities:
- 1404
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ------------------------------------ATGGGCATCTACCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC 38
||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGTGGAGGAGGCGTTCCAGGCGGTGGGCGAGATGGGCCTCTATCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC 74
Query 39 CGTGCTGCTGCAGCTCTACGTGGCCACGGAGGCCATCCTCATTGCACTGGTTGGGGCCACGCCATCCTACCACT 112
.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||.|||.|.|||||||
Sbjct 75 TGTGCTGCTGCAGCTTTATGTGGCCACAGAAGCCATCCTCATTGCACTGATTGGAGCTACACCAGCATACCACT 148
Query 113 GGGACCTGGCAGAGCTCCTGCCAAATCAGAGCCACGGTAACCAGTCAGCTGGTGAAGACCAGGCCTTTGGGGAC 186
|||||.||||.||.||||||||.||.|||||||||.|.||||||.|....||..|||.|||||||||.||||||
Sbjct 149 GGGACATGGCCGATCTCCTGCCCAACCAGAGCCACAGCAACCAGACTTTGGGCAAAGGCCAGGCCTTCGGGGAC 222
Query 187 TGGCTCCTGACAGCCAACGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAGCAGCTTCACCTCCATCGCCTC 260
|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.|||||
Sbjct 223 TGGCTGCTGACCGCCAATGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAACAGTTTCACCTCTATTGCCTC 296
Query 261 GGAGTGGTTTTTAATTGCCAACAGATCCTACAAAGTCAGTGCAGCAAGCTCTTTTTTCTTCAGTGGTGTATTTG 334
.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.||.|||||.|.|||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TGAGTGGTTTTTAATTGCCAACCGATCTTACAAAGTCAGCGCGGCCAGCTCCTCTTTCTTCAGTGGTGTGTTTG 370
Query 335 TTGGAGTTATCTCTTTTGGTCAGCTTTCAGATCGCTTCGGAAGGAAAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT 408
||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTGGTGTTATCTCCTTTGGTCAGCTTTCAGATCGATTTGGAAGGAGAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT 444
Query 409 GACATCTTATTTGCAATTGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAGTTCTTTGCAGTAACTCGCTTCCTGGTGGG 482
||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 GACATCTTATTTGCTGTCGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAATTCTTTGCAGTAACTCGCTTCTTGGTGGG 518
Query 483 CATGATGAATGGAGGGATGTCGCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTTAATGAGTGTGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC 556
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CATGATGAATGGAGGGATGTCCCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTAAATGAGTGCGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC 592
Query 557 TTGCAGGATCGATTGGCGGCCTCTTCTTTGCAGTTGGCATTGCCCAATATGCCCTGTTAGGATACTTCATCCGC 630
||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 593 TTGCAGGATCGATTGGTGGTCTCTTCTTCGCTGTTGGCATCGCGCAGTATGCCCTATTAGGGTACTTCATCCGC 666
Query 631 TCCTGGAGGACCCTAGCCATTCTGGTTAACCTGCAGGGAACGGTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA 704
|||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCTGGAGGACCCTAGCTGTTCTGGTCAACCTTCAGGGAACATTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA 740
Query 705 ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGACTGAGTGAGGCTGAAGAGGCGCTGTACCTCATTGCCAAGAGGA 778
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 741 ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGGCTGAGTGAGGCGGAAGAGGCTCTGTACTTCATTGCCAAGAGGA 814
Query 779 ACCGCAAACTCAAGTGCACGTTCTCACTAACACACCCAGCCAACAGGAGCTGCAGGGAGACTGGAAGTTTCCTG 852
|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||..||||||||.||||||
Sbjct 815 ACCGCAAGCTCAAGTGTACATTCTCACTAACACACCCGGCCAACAGGAGCTACAGGGCAACTGGAAGCTTCCTG 888
Query 853 GATCTCTTTCGTTACCGGGTCCTGTTAGGACACACTTTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT 926
|||||.||.|||||||||.||||..|||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATCTTTTCCGTTACCGGATCCTCCTAGGACATACCCTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT 962
Query 927 GTATTATGGCCTAACTCTGAGTGCGGGTGATCTAGGTGGAAGTATTTATGCCAACCTGGCCCTGTCTGGCCTCA 1000
|||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 963 GTACTACGGCCTCACCCTGAGTGCAGGTGACCTAGGGGGCAGCATTTATGCCAACCTGGCTCTATCTGGCCTCA 1036
Query 1001 TAGAGATTCAATCTTACCCTCTCTGTATCTACTTGATTAACCAAAAATGGTTTGGTCGGAAGCGAACATTATCA 1074
|||||||||.|||.|||||||||||.||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||.||
Sbjct 1037 TAGAGATTCCATCCTACCCTCTCTGCATCTACCTGATTAACCAAAGATGGTTTGGTCGGAAGCGGACACTAGCA 1110
Query 1075 GCATTTCTGTGCCTAGGAGGACTGGCTTGTCTTATTGTAATGTTTCTTCCAGAAAAGAAAGACACAGGTGTGTT 1148
||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GCGTTTCTGTGCCTTGGAGGACTGGCCTGTCTTATTGTGATGTTTCTTCCGGAAAAGAAAGACACAGGCGTGTT 1184
Query 1149 TGCAGTGGTGAACAGCCATTCCTTGTCCTTGCTGGGGAAGCTGACCATCAGTGCTGCCTTTAACATTGTTTATA 1222
|||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 TGCAGTGGTCAACAGCCATTCCTTGTCCCTGCTGGGGAAGCTGACCATCAGTGCTGCCTTTAACATTGTTTACA 1258
Query 1223 TCTACACCTCTGAGCTTTACCCTACAGTCATCAGGAATGTTGGGCTTGGAACTTGTTCCATGTTCTCCCGAGTT 1296
||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||.|.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259 TCTACACCTCTGAGCTGTACCCCACTGTCATCAGAAACGTTGGCCTGGGAGCGTGCTCCATGTTCTCCCGAGTC 1332
Query 1297 GGTGGGATTATTGCTCCCTTCATCCCCTCACTGAAATATGTGCAATGGTCTTTACCATTCATTGTCTTCGGAGC 1370
||||||||.|||||.||||||.|||||||.|||||..|.||.||.||||||.|.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1333 GGTGGGATCATTGCCCCCTTCGTCCCCTCCCTGAAGGAAGTACAGTGGTCTCTGCCCTTCATCGTGTTTGGAGC 1406
Query 1371 CACGGGTCTGACCTCCGGCCTCCTGAGTTTGTTATTGCCGGAGACCCTTAACAGTCCGCTGCTAGAAACATTCT 1444
|||.||.||||||||.|||||||||||..||.|||||||.|||||.||.|||||.||..||||.||.|||||.|
Sbjct 1407 CACAGGCCTGACCTCAGGCCTCCTGAGCCTGCTATTGCCAGAGACTCTGAACAGCCCTTTGCTGGAGACATTTT 1480
Query 1445 CCGACCTTCAGGTGTATTCGTATCGCAGGCTGGGAGAAGAAGCATTATCTTTACAGGCTTTGGACCCCCAACAG 1518
|.||.|||||..||||.||.|||.|.|||.|.|||||.|||||..|||||.|||||.|.|||||.||.|.||||
Sbjct 1481 CTGATCTTCAAATGTACTCATATAGGAGGTTAGGAGAGGAAGCGCTATCTCTACAGACCTTGGATCCTCCACAG 1554
Query 1519 TGTGTGGACAAGGAGAGCTCTTTAGGGAGTGAGAGTGAGGAAGAGGAAGAATTTTATGATGCAGATGAAGAGAC 1592
....|||||||||..||| ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555 CCCCTGGACAAGGTCAGC---------AGTGAGAGTGAGGAGGAGGAAGAGTTCTATGATGCAGATGAGGAGAC 1619
Query 1593 TCAGATGATCAAG 1605
.||||||||||||
Sbjct 1620 CCAGATGATCAAG 1632