Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12222
• Subject: NM_001130037.1
• Aligned Length: 1002
• Identities: 825
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGCACTTCCTGAGAATGTTGATCCAGGTATGCCTGTATTTTTACTGTAAATTTCTGTGGCGCTGCCTGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATTTGTAATGAGGAAGCTAACTGGAAGATGTGAACTACAACGGATCTGTTATAATACCAAGCCGGGAGCTTCTA  148

Query    1  -----ATGAAAATCGAAACATCACTGAGGGATTCTAAAAGTAAGCTGTTGCAGACTTCTGTGAGTGTTCACCCC  69
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAACCATGAAAATCGAAACATCACTGAGGGATTCTAAAAGTAAGCTGTTGCAGACTTCTGTGAGTGTTCACCCC  222

Query   70  GACGCTATTGAAAAAACTATAGAAGATATCATGGAACTGAAAAAAATTAATCCTGACGTAAATCCACAGCTGGG  143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGCTATTGAAAAAACTATAGAAGATATCATGGAACTGAAAAAAATTAATCCTGACGTAAATCCACAGCTGGG  296

Query  144  AATCTCTCTTCAGGCTTGCCTTCTGCAAATCGTTGGGTACAGGAACCTTATTGCAGATGTGGAAAAACTGCGTA  217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATCTCTCTTCAGGCTTGCCTTCTGCAAATCGTTGGGTACAGGAACCTTATTGCAGATGTGGAAAAACTGCGTA  370

Query  218  GAGAGGCCTATGATTCTGATAATCCCCAACATGAAGAAATGCTTTTGAAGTTATGGAAATTCTTGAAGCCCAAT  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGAGGCCTATGATTCTGATAATCCCCAACATGAAGAAATGCTTTTGAAGTTATGGAAATTCTTGAAGCCCAAT  444

Query  292  ACTCCACTGGAATCTCGGATTTCTAAGCAGTGGTGTGAAATTGGTTTCCAAGGTGATGATCCTAAAACAGACTT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTCCACTGGAATCTCGGATTTCTAAGCAGTGGTGTGAAATTGGTTTCCAAGGTGATGATCCTAAAACAGACTT  518

Query  366  TCGAGGAATGGGACTTCTGGGACTGTACAATTTGCAGTATTTCGCGGAAAGGGATGCCACAGCAGCTCAGCAGG  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGAGGAATGGGACTTCTGGGACTGTACAATTTGCAGTATTTCGCGGAAAGGGATGCCACAGCAGCTCAGCAGG  592

Query  440  TCCTGTCTGACTCTCTTCATCCGAAATGCAGGGATATCACTAAAGAAGAAATAAGCAAATTCAGCAAAGCAGAA  513
            |||||||||||||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTGTCTGACTCTCTTCATCCGAAATGC------------------------AGCAAATTCAGCAAAGCAGAA  642

Query  514  TGGGAGAAGAAAAGGATGGATAAGGCAATTGGGTACTCATTTGCAATTGTGGGCATCAATATAACTGACCTGGC  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  TGGGAGAAGAAAAGGATGGATAAGGCAATTGGGTACTCATTTGCAATTGTGGGCATCAATATAACTGACCTGGC  716

Query  588  ATATAATCTACTGGTCAGCGGAGCTCTAAAAACCCATTTCTACAATATCGCCCCAGAAGCTCCAACATTGTCTC  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  ATATAATCTACTGGTCAGCGGAGCTCTAAAAACCCATTTCTACAATATCGCCCCAGAAGCTCCAACATTGTCTC  790

Query  662  ACTTTCAGCAAACATTCTGCTATTTGATGCATGAATTTCATAAGTTTTGGATCGAAGAGGACCCCATGGACATA  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  ACTTTCAGCAAACATTCTGCTATTTGATGCATGAATTTCATAAGTTTTGGATCGAAGAGGACCCCATGGACATA  864

Query  736  ATGGAATTTAATCGTGTGAGGGAGAAATTCCGCAAGAGGATCATCAAACAGCTGCAGAACCCAGACATGGCGCT  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  ATGGAATTTAATCGTGTGAGGGAGAAATTCCGCAAGAGGATCATCAAACAGCTGCAGAACCCAGACATGGCGCT  938

Query  810  GTGCCCACATTTTGCTGCCTCGGAAGGTTTAATCAACATG  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  GTGCCCACATTTTGCTGCCTCGGAAGGTTTAATCAACATG  978